В настоящее время сельское хозяйство ещё недостаточно окрепло после кризиса, вызванного трансформацией всей экономики государства. По этой причине продолжает увеличиваться разница между городским и сельским уровнем жизни, происходит обезлюдение сельских территорий, ухудшение качества трудовых ресурсов, снижение занятости при недостатке квалифицированной рабочей силы. Тормозят выход из кризиса ряд факторов:
1. Межведомственная разобщённость в управлении сельскими территориями, которая проявляется в управлении социально-экономическим развитием села на федеральном, региональном и местном уровнях управления. Это приводит к тому, что преобладает узкоотраслевой аграрный подход к развитию экономики села при отсутствии целостной стратегии и эффективных моделей устойчивого развития сельских поселений. В настоящее время реализуются приоритетные национальные проекты «Образование», «Здоровье», «Доступное и комфортное жильё — гражданам России», а также другие федеральные и ведомственные программы и проекты. Но эти программы и законодательные акты не охватывают всего комплекса проблем сельского развития. Ресурсы, направляемые по этим программам, рассредоточены и нередко используются неэффективно. Министерства и ведомства, выделяя средства на развитие производственной и инженерной инфраструктуры, не учитывают уровень развития социальной инфраструктуры. В результате снижается эффективность использования бюджетных средств, а проблемы комплексного развития сельских поселений консервируются.
2. Ограничение доступа жителей села к ресурсам жизнеобеспечения и затруднения по их эффективному использованию. Так доступ к пустующим сельскохозяйственным угодьям широких слоёв сельского населения пока ограничен. Основная проблема заключается в сложности и больших издержках, связанных с формированием земельных участков за счёт долей в праве общей собственности из земель сельскохозяйственного назначения. Стоимость проведения землеустроительных работ и кадастрового учёта 1 гектара сельскохозяйственных земель в настоящее время составляет 300 — 500 рублей при применении простого картографического метода и до 1500 рублей при инструментальном способе межевания, что для большей части сельского населения является обременительным.
В некоторых субъектах федерации предусмотрена поддержка сельскохозяйственных товаропроизводителей за счёт регионального бюджета при проведении землеустроительных и кадастровых работ. Однако, из-за отсутствия необходимых средств, в большом количестве регионов кадастровые работы не проведены, поэтому значительная часть земель, находящихся в общей долевой собственности, находится в использовании сельскохозяйственных организаций без надлежащего правового оформления.
Несмотря на то, что Правительство Российской Федерации были приняты меры по обеспечению сельского населения субсидированными кредитами и льготным строительством (приобретением) жилья, доступ жителей села к финансово-кредитному обслуживанию остаётся ограниченным. Основными причинами являются низкие доходы сельских семей, не позволяющие обслуживать кредиты, отсутствие земельного обеспечения, ограничения, связанные с целевым использованием кредита, а также недостаточная информированность сельского населения о мерах государственной поддержки.
Важным шагом по улучшению доступа сельского населения к рынкам материально-технических ресурсов и рынков сбыта было решение о содействии и развитии сети сельскохозяйственных потребительских кооперативов различной направленности (снабженческо-сбытовых, перерабатывающих, кредитных).
Несмотря на то, что темпы развития сельскохозяйственных потребительских кооперативов достаточно высокие, объёмы закупок продукции и оказываемых ими услуг пока отстают от потребностей сельского поселения и занимают незначительную долю в общем объёме реализации сельскохозяйственной продукции, произведённой мелкими формами хозяйствования на селе.
В некоторых регионах России сельские территории изолированы от основных электросетей в связи с территориальной отдалённостью. Подключение к электросетям оказывается дорогостоящим и при этом снабжение электроэнергией осуществляется по 3ей категории надёжности. Не имея доступа к сетям, жители вынуждены использовать более дорогостоящие керосин и аккумуляторы.
3. Отсутствие системы научно обоснованных, учитывающих особенности расселения и образа жизни сельского населения стандартов его обеспечения общественными услугами, определяющими необходимые обязательства государства и гарантирующими гражданам реализацию их конституционных прав на жилище, образование, медицинскую помощь, доступ к культурным, торговым, бытовым и другим общественным услугам, а также стандартов, отражающих целевые программы развития различных сельских территорий, поэтапное достижение которых по мере экономического роста должно поддерживаться государством, коммерческими структурами и гражданским обществом.
4. Слабое развитие факторов гражданского общества в сельской местности и, прежде всего, местного самоуправления. Большинство сельских территорий имеют низкую бюджетную обеспеченность и дотационный бюджет, отсутствует система стимулирования гражданских инициатив, всё это лишает сельские сообщества возможности реализовывать проекты развития, особенно на депрессивных территориях.
5. Недостаточное научное, статистическое и кадровое обеспечение устойчивого развития сельских территорий. Не проводятся исследования в сфере методологии измерения уровня и качества жизни в сельских поселениях, социальной обеспеченности развития сельских территорий и количественной оценки общественной пользы, производимой селом. Не производится расчёт перспективы предложения рабочих мест для обеспечения полной занятости сельского населения. Не разработаны методики финансового обеспечения местного самоуправления в сельских поселениях, стимулирование переселения молодёжи на село, привлечение других категорий переселенцев.
В администрациях сельских муниципальных образований недостаточно специалистов, подготовленных для компетентного участия в решении сельских проблем, что снижает эффективность управления сельским развитием.