Полномочия Президента РФ вытекают из его функций и представляют собой конкретные права и обязанности главы государства по вопросам, отнесенным к его компетенции. Те полномочия, которые присущи только Президенту РФ и не разделяются им с парламентом, Правительством РФ и органами судебной власти, называются его прерогативами.
Президент РФ назначает высших должностных лиц (ст. 83 Конституции РФ):
а) по представлению - Председателя Центрального банка РФ;
б) по предложению Председателя Правительства РФ - заместителя Председателя Правительства РФ, федеральных министров, по предложению Государственной Думы - Председателя Правительства РФ;
в) предлагает Совету Федерации кандидатуры для назначения на должности судей Конституционного Суда РФ, Верховного Суда - РФ, Высшего Арбитражного Суда РФ, а также Генерального прокурора РФ;
г) назначает полномочных представителей Президента РФ, высшего командования Вооруженных Сил РФ, дипломатических представителей РФ в иностранных государствах и международных организациях.
Президент РФ наделен правом законодательной инициативы. Законопроекты Президента РФ, внесенные им на рассмотрение Государственной Думы, считаются приоритетными в программе законотворчества.
Президент РФ назначает выборы Государственной Думы (ст.84 Конституции РФ). Назначение даты выборов - не право, а скорее обязанность Президента РФ, т. к. он делает это не произвольно, по своему усмотрению, а в строго определенный срок. Это относится и к назначению внеочередных выборов в Думу после ее роспуска (п. 2 ст. 109 Конституции РФ).
Президент имеет право назначать референдум. Это право обеспечивает ему активную позицию в проведении реформ.
Президент имеет право на роспуск Государственной Думы. Конституция РФ предусматривает два случая, когда нижняя палата может быть распущена: трехкратное отклонение представленных кандидатур председателя Правительства РФ (п. 4 ст. 111) и повторное выражение недоверия Правительству РФ в течение 3 месяцев (п. 3 ст. 117). В последнем случае роспуск Государственной Думы не является обязательным: в качестве альтернативы Президент РФ может объявить об отставке Правительства РФ.
Полномочия Президента в области исполнительной власти: активно участвует в формировании Правительства РФ; объявляет об отставке Правительства РФ; имеет право председательствовать на заседаниях Правительства РФ; является надзорной инстанцией по отношению к Правительству РФ, пользуясь правом отмены решений Правительства РФ.
Президент РФ формирует и возглавляет Совет Безопасности - совещательный коллегиальный орган, в состав которого по должности входят: министры обороны, иностранных дел, внутренних дел, директор Службы внешней разведки, директор Федеральной службы контрразведки и др. лица.
Также президент утверждает военную доктрину РФ (документ, в котором зафиксированы военные, военно-политические, военно-технические и экономические основы официально принятых в государстве взглядов на предотвращение войны, конфликтов военного характера, защиту жизненно важных интересов РФ), является Верховным Главнокомандующим Вооруженными Силами РФ, вводит в установленных случаях на территории России или в отдельных ее местностях чрезвычайное положение и военное положение.
Президент РФ осуществляет руководство внешней политикой, в основном через Министерство иностранных дел РФ, но и сам принимает активное участие в реализации внешней политики Российские Федерации. Президент РФ также ведет международные переговоры и участвует в важнейших международных дипломатических форумах.
Президент подписывает международные договоры Российской Федерации, которые признаются составной частью ее правовой системы, подписывает ратификационные грамоты - документы, свидетельствующие об утверждении федеральным законом международного договора Российской Федерации. Он принимает верительные и отзывные грамоты аккредитуемых при нем дипломатических представителей иностранных государств (ст. 86 Конституции РФ) и назначает дипломатических представителей России в зарубежных странах.
В сфере регулирования правового статуса личности Президент РФ наделен следующими полномочиями (ст. 89 Конституции РФ): принимает лиц в гражданство Российской Федерации, разрешает выход из гражданства; предоставляет политическое убежище; награждает государственными наградами Российской Федерации; присваивает почетные звания Российской Федерации, высшие воинские и высшие специальные звания; осуществляет помилование.
Президент РФ оформляет свои решения, издавая правовые акты. Акты Президента РФ не подлежат утверждению законодательным органом, за исключением указов о введении военного и чрезвычайного положения. Они представляют собой разновидность подзаконных актов и не должны противоречить Конституции РФ и федеральным законам, но в иерархии подзаконных актов указы Президента РФ стоят выше, чем постановления и распоряжения Правительства РФ и обладают большей юридической силой.
Ст. 90 Конституции РФ предусматривает две разновидности актов Президента РФ: указы (нормативные документы, содержат общие правила поведения, адресованные неопределенному кругу лиц и рассчитанные на многократное применение; являются основной формой реализации прерогатив Президента РФ по управлению государством) и распоряжения (не содержат нормативных предписаний).