Прокариоты отнесены к низшим протистам, клетки которых по строению существенно отличаются от всех других организмов (бактерии и сине-зеленые водоросли).
Прокариотические клетки устроены проще. В них нет четкой границы между ядром и цитоплазмой, отсутствует мембрана; ДНК не образует структур, похожих на хромосомы эукариот, поэтому у прокариот не происходят процессы митоза и мейоза. У большинства прокариот отсутствуют внутриклеточные органелы, ограниченные мембранами, а также митохондрии и хлоропласты; рибосомы свободно лежат в цитоплазме.
В настоящее время описано более 3,5 тыс. видов бактерий, но их число постоянно возрастает. Разобратся в этом поразительном многообразии возможно благодаря систематике.
Все прокариотические микроорганизмы объединены в царство Procaryotae (Murray, 1968), которое подразделяется на четыре отдела. Они в свою очередь, делятся на секции, классы, порядки, семейства, роды, виды.
Отдел I. Gracilcutes (от лат. Gracilus - тонкий, стройный, cutes - кожа). Включает в себя грамотрицательные микроорганизмы. В отделе девять секций.
Секция 1. Спирохеты. Порядок Spirochaetales. Включает в себя два семейства: Spirochaetaceae (четыре рода), Leptospiracaea (один род).
Секция 2. Спиралеведные и изогнутые аэробы (микроаэрофилы). Одно семейство - Spirillaceae, в котором шесть родов. Патогенны для человека и животных микроорганизмы рода Campylobacter.
Секция 3. Грамотрицательные неподвижные изогнутые бактерии. Одно семейство - Spirosomonnaceae, в котором патогенных три рода.
Секция 4. Аэробные грамотрицательные палочки, округлые и кокки. Восемь семейств, два из которых имеют патогенные микроорганизмы. Семейство Pseudomonadaceae включает в себя четыре рода, более 25 видов, среди которых имеются патогенные (Ps. mallei и др.). Семейство Neisseriaceae имеет 16 родов. Роды Neisseria и Moraxella содержат патогенные для человека и животных микроорганизмы.
Роды Bordetella, Brucella и Francisella не внесены в семейства: содержат патогенные для человека и животных микроорганизмы.
Секция 5. Грамотрицательные факультативные анаэробы. Три семейства: Enterobacteriaceae, Vibrionaceae и Pasteurellaceae. Семейство Enterobacteriaceae имеет 14 родов (Escherichia, Salmonella, Citrobacter, Klebsiella, Enterobacter, Erwinia, Shigella, Proteus, Yersinia и др.). Семейство Vibrionaceae имеет два рода. В род Vibrio включены патогенные микроорганизмы. Семейство Pasteurellaceae имеет три основных рода: Pasteurella, Haemophilus и Actinobacillus. Содержат патогенные виды микроорганизмов.
Секция 6. Строгие анаэробы. Изогнутые грамотрицательные палочки. Одно семейство - Bacteroidaceae, в котором 13 родов, среди которых имеются патогенные.
Секция 7. Диссимилирующие и разлагающие сульфат бактерии. Семь непатогенных родов.
Секция 8. Анаэробные грамотрицательные кокки. Одно семейство - Vellonellaceae, в котором три рода.
Секция 9. Риккетсии и хламидии. Два порядка: Rickettsiales и Chlamydiales. Порядок Rickettsiales имеет три семейства: Rickettsiaceae, Bartonellaceae и Anaplasmataceae. Семейство Rickettsiaceae имеет три трибы, в которые внесено восемь родов. Семейство Bartonellaceae содержит два рода, а Anaplasmataceae - четыре. Порядок Chlamydiales имеет одно семейство Chlamydiaceae и один род - Chlamydia. Все семейства содержат патогенные микроорганизмы.
Отдел II. Firmicutes (от лат. Firmis - крепкий, cutes - кожа). В отдел включены главным образом грамположительные бактерии.
Секция 12. Грамположительные кокки. Два семейства: Micrococcaceae и Deinococcaceae. Семейство Micrococcaceae имеет четыре рода: Micrococcus, Stomatococcus, Planococcus, Staphylococcus.
В секцию кроме указанных двух семейств внесены десять самостоятельных родов: Streptococcus, Leuconostos, Pedicoccus, Sarcina и др.
Секция 13. Спорообразующие грамположительные палочки и кокки. Шесть родов: Bacillus, Clostridium, Sporolactobacillus, Sporosarcina и др. Первые два рода имеют патогенные виды.
Секция 14. Неспорообразующие грамположительные палочки. Семь родов: Lactobacillus, Listeria, Erysipelotrix и др. Имеются патогенные.
Секция 15. Неспорообразующие внутриклеточные грамоположительные палочки. 21 род: Corynebacterium, Micobacterium, Propionibacterium, Eubacterium, Asotobacterium, Bifidobacterium,Actinomices и др.
Секция 16. Микобактерии. Одно семейство Mycobacterioceae. Семейство имеет один род Mycobacterium, в котором 49 видов: Myc. tuberculosis, Mys. bovis, Mys. avium, Myc. paratubberculosis, Mys. lepra и др.
Секция 17. Nocardioforms. Девять родов: Nocardia, Pseudococcus, Pseudonocardia и др.
Отдел III. Tenericutes. Объединены грамотрицательные прокариоты без клеточной стенки, но имеющие цитоплазмотическую мембрану. В отделе десятая секция - микоплазмы, класса Mollicutes (от лат. Molli -мягкий, cutes - покров, кожа). В классе один порядок - Mycoplasmatales - и три семейства: Mycoplasmataceae, Acholeplasmataceae, Spiroplasmataceae. В основном патогенные микоплазмы включены в семейство Mycoplasmataceae.
Отдел IV. Mendosicutes. Прокариоты, среди которых нет патогенных бактерий; метанобразующие, сероокисляющие, галофилы, микоплазмоподобные, термофцидофильные и другие наиболее древние по происхождению бактерии (архебактерии).