МИНИСТЕРСТВО ОБРАЗОВАНИЯ И НАУКИ РОССИЙСКОЙ ФЕДЕРАЦИИ
РЯЗАНСКИЙ ГОСУДАРСТВЕННЫЙ РАДИОТЕХНИЧЕСКИЙ УНИВЕРСИТЕТ
Кафедра автоматизированных систем управления
Предварительная обработка и расчет статистических характеристик спектрозональных изображений.
Методическое пособие по программе ImageJ
Выполнили:
Авилкин Н.В.
Власова Н.А.
Червоткин С.В.
Проверил:
Дондик Е. М.
Рязань 2012
Основная информация о программе ImageJ - особенности и возможности
ImageJ (Image Processing and Data Analysis in Java) - программа специально разработанная для анализа медицинских и биологических изображений. Эта программа имеет открытый код и свободно распространяется.
Программа ImageJ – мощный графический редактор для обработки и анализа изображений. Кампания по разработке ImageJ инициирована автором Вейном Расбандом (Wayne Rasband) в Национальных Институтах Здравоохранения США (National Institutes of Health, USA).
Основные возможности ImageJ
· Автоматический и ручной подсчет объектов
· Измерение площади, периметра выделения в реальных единицах (см, мкм, и т.п.)
· Измерение значений яркости и оптической плотности
· Формирование гистограмм
· Работа со стеками изображений
· Написание макросов и плагинов для конкретных задач
Особенности программы ImageJ
Работает в различных ОС:
ImageJ работает под управлением Linux, Mac OS 9, Mac OS X, Windows и Sharp Zaurus PDA.
Самую свежую версию под Вашу операцинную систему можно скачать на странице загрузкок.
.
Скорость:
ImageJ - одна из самых быстрых в мире программ по обработке изображений, написанных на Java. Она может проводить фильтрацию изображения размером 2048x2048 за 0,1 сек. Это приблизительно 40 миллионо пикселей в секунду! (Тестирование проводилось на 8-bit изображении, 3GHz Windows PC, IE 6.0, Microsoft Java 1.1.4.).
Типы изображений:
Типы изображений могут быть различными: 8-битные (полутоновые), 16-битные (беззнаковые), 32-битные (с плавающей точкой) или RGB (цветные).
Форматы файлов:
ImageJ поддерживает все известные форматы изображений (GIF, JPEG, BMP, PNG, PGM), а также DICOM, RAW, FITS и ASCII.
Отображение изображений:
Инструменты обеспечивают увеличение и уменьшение (от 1:32 до 32:1), а также скроллинг изображений. Все анализы и функции работы с изображениями корректно работают на любом из этих увеличений.
Выделения:
В программе ImageJ можно использовать различные типы выделений объектов: создавать прямоугольные, эллиптические, свободные по форме области. Создавать линейное или точечное выделение. Редактировать выделения и автоматически создавать их, используя инструмент "волшебная палочка" - wand tool. Рисовать, заполнять, очищать фильтровать или измерять выделенные фрагменты. Сохранять области выделенияи переносить их в другие изображения.
Расширение изображения:
Поддерживает сглаживание, увеличение резкости, нахождение границ, недианную фильтрацию и использование функции порог как для 8-bit полутоновых, так и для RGB цветных изображений. Возможно интерактивно настраивать яркость и контраст в 8-, 16- и 32-битных изображениях.
Геометрические операции:
В программе можно обрезать, масштабировать, менять размер изображений и вращать их. Отражать как горизонтально, так и вертикально.
Анализ:
Одна из главных возможностей программы ImageJ - возможность проводить измерение площади, периметра, значений яркости и многих других показателей изображения или выделения. При этом можно применять единицы измерения реального мира (см, мкм, и т.п.). Оценивать градуировки по стандартам плотности изображения. Формировать гистограммы и профили линий.
Редактирование:
Доступны все стандартные инструменты: вырезать, копировать, вставить. Есть возможность использовать процедуру вставки используя режимы AND, OR, XOR или "смешивание". Добавлять текст, стрелки, прямоугольники, овалы или многоугольники на изображение.
Работа с цветом:
ImageJ может раскладывать 32-битные цветные изображения на RGB или HSV компоненты, а также объединять 8-битные компоненты в цветное изображение. Конвертировать изображение RGB в 8-битные цветные. Применять палитры псевдоцветов для полутоновых черно-белых изображений.
Стеки:
Программа ImageJ позволяет представить стек связанных изображений в одном окне и работать с целым стеком, используя для этого все команды. Также ImageJ может открывать папку с изображениями как стек и сохранять стеки как множество файлов.
Программа ImageJ имеет по настоящему неограниченный потенциал для решения всевозможных задач анализа изображений от измерения внутриклеточных структур, анализа гистологических препаратов, морфометрического изучения макрообъектов в медицине и биологии до применения ее в материаловедении и астрономии.