На сегодняшний день в Архангельской области 105 ООПТ. Из них федеральный статус имеют 6 особо охраняемых природных территорий.
Пинежский заповедник – Пинежский район 1974 г. (в августе 2009 – 35 лет). Пинежский заповедник расположен на юго-востоке Беломорско-Кулойского плато, в области широкого развития древнего и современного карста. Разнообразие карстового и ледникового рельефа, их сочетание определяют природоохранную значимость данной территории. На территории Пинежского заповедника к началу 2008 года найдена 91 пещера, Это составляет 1/4 всех пещер, зарегистрированных в настоящее время во всей Архангельской области. ПещерыПинежского заповедника своеобразны и неповторимы; они отличаются гармоничностью строения, красотой пород, в которых образованы, активным современным развитием, наблюдаемым в короткие отрезки времени. В большинстве значительных пещер действуют постоянные ручьи и реки, либо происходит разгрузка временных паводковых потоков. В ряде пещер имеются водопады на ручьях, вертикальные капельные источники, реже встречаются подземные озера. Изучение карста и пещер в пределах территории заповедника имеет короткую (ее 40 лет), но захватывающе интересную историю. Она включает и неожиданные находки и открытия и разочарования. Открытие новых пещер - это последние географические открытия на нашей планете. Их поиск и изучение процесс достаточно сложный, требующий как специальных знаний и навыков, так и хорошей физической подготовки. Это работа коллективная, сложная и кропотливая. Требуется не только обнаружить и осмотреть пещеру, но и провести в ней топографическую съемку, изучить геологическое строение, особенности микроклимата и гидрологии.
Уникальность природы заповедника связана с карстовыми ландшафтами, образовавшимися под воздействием поверхностных и подземных вод. Именно благодаря карстовому рельефу здесь сохранились свидетели прошлых геологических эпох - реликтовые виды растений и животных. С наступлением ледника продвигались к югу и его спутники-растения. После отступания ледника началось заселение территории растениями умеренных широт. Растения-спутники ледника сохранились лишь там, где из-за суровых условий обитания у них не было конкурентов: вблизи ледников в высокогорьях и в современных полярных областях. В заповеднике они растут на бесплодных скалах и осыпях. На выровненных местах господствуют бореальные, таежные виды, вытеснив оттуда арктоальпийские.
Заповедник - хранитель многих редких видов флоры и фауны, исчезающих на освоенных человеком пространствах. На его территории обитают занесенные в Красную книгу России виды растений (башмачок настоящий, калипсо луковичная, надбородник безлистный, пальчатокоренник Траунштейнера, качим пинежский, лобария легочная, бриория Фремонта) и животных (бабочка мнемозина, бычок-подкаменщик, скопа, филин и серый сорокопут). В заповеднике обитают самая мелкая сова — воробьиный сыч и самая крупная — филин, но они редки, их чаще можно услышать, чем увидеть. Многочислен, но скрытен мохноногий сыч.
Кенозерский национальный парк – (Плесецкий и Каргопольский районы) – особо охраняемая природная территория, один из последних островков исконного русского жизненного уклада, культуры, традиций, выдающийся образец североевропейского культурного ландшафта.
Со всех сторон Кенозерский национальный парк окружают леса, да и сама территория Парка на три четверти покрыта лесной таёжной растительностью. Хозяйственное освоение территории значительно изменило их облик. В современных лесах Парка преобладают смешанные по составу и сложные по строению древостои, в основном – сосновые и еловые насаждения, возраст которых не превышает 120 лет. Относительная молодость лесов связана с довольно активным применением в прошлом подсечно-огневого земледелия, кардинально изменившим их возрастную и породную структуру. Тем не менее, на территории Парка сохранились фрагменты коренных лесов (около 5 тысяч га), практически не затронутых хозяйственной деятельностью. Они расположены в низинных, заболоченных местах и представлены ельниками долгомошными и сосняками сфагновыми. Возраст деревьев, растущих там, от 160 до 350 лет.
Фауна лесов Кенозерского национального парка насчитывает 50 видов млекопитающих, среди которых доминируют представители европейской тайги. Из мелких млекопитающих фоновыми видами являются рыжая полевка, темная полевка, обыкновенная бурозубка. В лесных биотопах наиболее многочисленны белка, заяц-беляк, куница; на лугах и вырубках – горностай, лисица; на речках, ручьях и озерах – норка, выдра и бобр. У восточных границ своего ареала обитают бурундук, европейская норка. Обычны в лесах Парка такие жители таёжных лесов, как медведь, росомаха, рысь, лось, кабан.
Всего на территории Парка отмечено произрастание 715 видов высших сосудистых растений из 96 семейств, из которых 25 относятся к категории редких и исчезающих.
Кенозерье – дошедший до наших дней живой пример древнерусского мироустройства с почти 100 церквами и часовнями на островах, среди озёр и лесов, небольшими деревушками с приветливыми жителями, древними монастырями в глухих лесах, священными рощами, поклонными крестами. Кенозерский героический эпос вошел в сокровищницу фольклористики огромным наследием. Историческая память населения придает этим местам глубокое духовное содержание.
Водлозерский национальный парк - Онежский район и республика Карелия.В Парке сохранился самый крупный в Европе массив репрезентативных зональных коренных сообществ бореальных хвойных лесов, включающих девственные климаксовые сообщества ельников и сосняков. Значительная часть территории Парка является одним из крупнейших в мире и самым большим в Европе комплексным болотно-лесным заповедником. При этом болота занимают свыше 40% всей площади Парка. Ненарушенные верховые и переходные болота отличаются полнотой и разнообразием видового состава. Для Парка также характерен естественный ход гидрологических процессов, отсутствие какого-либо антропогенного воздействия и загрязнения, что является большой редкостью в настоящее время.
В Парке расположены места обитания ряда видов животных и растений, имеющих всемирное значение для науки и сохранения биоразнообразия природы. В Водлозерском национальном парке сохраняется большое количество редких видов фауны; охраняется ряд представителей фауны, внесенных в международную Красную книгу МСОП, среди которых особо важное значение имеют рыбоядные хищные птицы (орлан-белохвост, скопа, а также беркут). Водно-болотные угодья Парка имеют международное значение как узел миграции и размножения водоплавающих птиц (гагары, лебеди, утки, гуси, кулики и чайковые птицы), в том числе редкие (лебедь малый, кликун, белощекая казарка).
Данная территория представляет собой важнейший в таежной зоне Европы очаг репродукции характерных для этой зоны видов животных и растений.
В Парке сосредоточена крупнейшая в Европейской части России группировка тетеревиных и популяция куниц. Водлозерский парк обеспечивает репродукцию этих, а также других таежных видов (бурый медведь, волк, лисица, рысь, норка европейская, росомаха, барсук и т.д.) на обширную окружающую территорию, в 15-20 раз превышающую по площади Парк. Флора Парка отличается необычно высокой насыщенностью восточными, сибирскими и редкими видами. Парк фактически выполняет роль рефугиума этих видов в Европе. (Биосферные Резерваты ЮНЕСКО).
В июне 2009 г. был создан национальный парк федерального значения «Русская Арктика». Месторасположение: в границах муниципального образования «Новая Земля» Архангельской области в северной части архипелага Новая Земля на землях запаса общей площадью 1 426 000 га, в том числе 632 090 га - суша и 793 910 га - акватория территориальных вод Российской Федерации. Основные задачи:
· на островах национального парка находится один из важнейших очагов размножения белого медведя.
· на акватории района, в течение всего года обитают еще два вида очень редких морских млекопитающих - нарвал и гренландский кит.
· северная оконечность Новой Земли входит в ареал эндемичного для Баренцевоморского региона подвида северного оленя.
· на территории Новой Земли расположены основные круглогодичные береговые лежбища моржей.
Сийский государственный биологический заказник федерального значения находящийся на юго-западе Холмогорского района. Образован с целью сохранения, воспроизводства и восстановления численности, ценных в хозяйственном, научном и культурном отношениях диких животных, а также охраны их среды обитания. Площадь заказника – 43 тысячи гектаров.
Государственный природный заказник федерального значения Земля Франца Иосифа учрежден в 1994году. Создан для сохранения природных комплексов в естественном состоянии, прежде всего мест залегания в берлоги белых медведей, лежбищ моржей, птичьих базаров, колоний обыкновенной гаги и белой чайки, мест нагула ластоногих, а также мест сбора корма морских птиц.