В начале сентября «Милиция Татарского пролива» помогла десантом Сибирской флотилии, ведшей борьбу с красными партизанами в районе реки Терней.
6 сентября в Охотске был высажен десант. В Охотске создавалась база под руководством коменданта капитана Михайловского. Также была создана группа генерала Ракитина, которая должна была двигаться вглубь Якутии, на соединение с основными силами Пепеляева. Цель разделения — Ракитин должен был двигаться по Амгино-Охотскому тракту и собирать в ряды «Милиции» белопартизан. Сам же Пепеляев поплыл на кораблях вдоль побережья на юг и 8 сентября высадился в Аяне. В тот же день было собрано собрание, на котором Пепеляев сообщил о переименовании «Милиции Татарского пролива» в «Сибирскую Добровольческую Дружину» (СДД).
12 сентября состоялся Народный съезд тунгусов, который передал СДД 300 оленей.
14 сентября, оставив в Аяне гарнизон в 40 человек, Пепеляев двинул основные силы дружины в 480 человек по Амгино-Аянскому тракту через горный хребет Джугджур к селу Нелькан.
Однако на подходе к Нелькану была дана днёвка, во время которой бежало трое добровольцев. Они донесли красному гарнизону Нелькана о приближении СДД, в связи с чем комендант Нелькана, чекист Карпель, разогнал местных жителей и уплыл с гарнизоном вниз по реке Мая.
27 сентября, спустя два часа после того, как город был покинут, Пепеляев занял Нелькан. Всё, что удалось найти СДД, были 120 винчестеров и 50 000 патронов к ним, которые были зарыты красными.
Пепеляев осознал, что поход был плохо подготовлен, и в октябре уехал с охраной в Аян, оставив основные силы в Нелькане.
Вернувшись 5 ноября 1922 в Аян, Пепеляев укрепился в своём намерении идти на Якутск, так как в Аян прибыл корабль с Вишневским, который привёз с собой ещё 187 добровольцев и провиант.
В середине ноября отряд Пепеляева и Вишневского отправился в Нелькан, прибыв туда в середине декабря. В то же время из Охотска по направлению в Якутск отправился Ракитин.
К декабрю в Нелькан вернулись жители-тунгусы, которые на своём собрании выразили поддержку СДД и снабдили Пепеляева оленями и провиантом.
В начале января 1923 года, когда все белогвардейцы уже были разбиты, СДД двинулась из Нелькана на Якутск. Вскоре к ней присоединился отряд белопартизан Артемьева и охотский отряд Ракитина.
5 февраля была занята слобода Амга, где Пепеляев разместил свой штаб.
13 февраля отряд Вишневского атаковал красноармейский отряд Ивана Строда в аласе Сасыл-Сысыы. Атака была неудачной и Строд смог укрепиться в Сасыл-Сысыы.
Так началась последняя драматическая битва в истории Гражданской войны в России, легендарное ледовое противостояние молодых военачальников И. Строда и А. Пепеляева. Анатолий Пепеляев отказался двигаться дальше на захват Якутска, пока Строд и его отряд не будут взяты в плен.
27 февраля Ракитин был разбит отрядом красных партизан Курашова и начал отступление к Сасыл-Сысыы. Из Якутска против Пепеляева вышел отряд Байкалова, который, соединившись с Курашовым, достиг 760 человек.
С 1 по 2 марта шли бои у Амги, и Пепеляев был разбит.
3 марта была снята осада Сасыл-Сысыы — началось бегство в Аян. Ракитин бежал в Охотск. Красные начали погоню, но на полпути остановились и вернулись.
1 мая отряды Пепеляева достигли Аяна. Здесь они решили строить кунгасы и плыть на них на Сахалин. Но их дни были уже сочтены, поскольку уже 24 апреля из Владивостока отплыл отряд Вострецова, целью которого была ликвидация СДД.
В начале июня 1923 был ликвидирован отряд Ракитина в Охотске, а 17 июня Вострецов занял Аян. Во избежание кровопролития, 19 июня Пепеляев сдался без сопротивления. 24 июня пленённая СДД была отправлена во Владивосток, куда она прибыла 30 июня.
Суд и заключение
Анатолий Пепеляев (в первом ряду в центре) на судебном заседании в Чите (январь 1924 г.)
Во Владивостоке военный суд приговорил Пепеляева к казни, но он написал письмо Калинину с просьбой о помиловании. Просьба была рассмотрена, и в январе 1924 в Чите состоялся суд, приговоривший Пепеляева к 10 годам тюрьмы.
II. Проблема определения причин возникновения Гражданской войны. По данной проблеме существуют две диаметрально противоположных точки зрения:
• В советской исторической науке (Н. Азовцев, Л. Спирин, В. Наумов, Ю. Кораблев) вся вина и ответственность за начало Гражданской войны в стране целиком и полностью возлагалась на свергнутые эксплуататорские классы.
Большая часть этой вины возлагалась на эсеров и меньшевиков, которые, предав интересы рабочего класса и трудового крестьянства, отказались пойти на широкий политический союз с партией большевиков и сознательно перешли в лагерь монархической и буржуазно-помещичьей контрреволюции.
• В настоящее время многие историки, главным образом либерального толка (Б. Клейн, В. Бровкин, И. Долуцкий), ударились в другую крайность и стали утверждать, что главная ответственность за начало братоубийственной Гражданской войны целиком и полностью лежит на партии большевиков, которая вполне сознательно через создание комбедов и политику продразверстки (продотряды) развязала новую социальную войну в деревне, которая и стала питательной базой для эскалации широкомасштабной войны в стране.