Уже во время войны идеологический курс режима стал заметно меняться. В 1943 г. вместо «Интернационала» был принят новый гимн СССР, начинавшийся словами «Союз нерушимый республик свободных сплотила навеки великая Русь». Тогда же были введены погоны, командиры стали называться офицерами. В 1946 г. наркоматы переименовали в министерства, служащие различных ведомств получили форму. Все это очень напоминало дореволюционную Россию. На приеме в честь участников парада Победы летом 1945 г. Сталин поднял тост «за великий русский народ, наиболее выдающуюся нацию из всех наций СССР». Русский народ все чаще именовали старшим братом других народов СССР.
В 1947 г. были запрещены браки советских граждан с иностранцами. Были созданы так называемые суды чести, призванные «повести непримиримую борьбу с низкопоклонством и раболепием перед западной культурой, ликвидировать недооценку значения деятелей русской науки и культуры в развитии мировой цивилизации». Началась «борьба за приоритеты»: авторы многочисленных статей и книг доказывали, что родиной едва ли не всех важнейших открытий и изобретений (закона сохранения вещества, паровой машины, паровоза, воздухоплавания, самолета и т.п.) была Россия. Любые ссылки на труду зарубежных ученых стали невозможны. Это привело к фактическому разрыву связей с иностранной наукой и нанесло большой вред науке отечественной.
Усиление национализма и шовинизма в идеологии обернулось государственным антисемитизмом. В 1948 г. были арестованы и в 1952 г. расстреляны члены созданного во время войны Еврейского Антифашистского комитета. Лидер комитета артист С.М. Михоэлс был убит агентами МГБ, а убийство замаскировано под автокатастрофу. В 1949 г. началась кампания борьбы с космополитизмом. Слову «космополит» (букв. «гражданин мира») было придано значение «непатриот». Появилось выражение «безродные космополиты». Людей, обвиненных в космополитизме (в основном евреев), увольняли с работы и не давали им возможности найти новое место.
В 1952 г. была арестована большая группа врачей, работавших в Лечебном управлении Кремля. Большей частью арестованные были евреями. Их обвинили в убийстве А.А. Жданова, А.С. Щербакова, М.И. Калинина по заданию «международной еврейской буржуазно-националистической организации «Джойнт», созданной американской разведкой». Врач Л. Тимашук, донос которой стал основанием для арестов, была награждена орденом Ленина. Сталин лично требовал от органов МГБ довести «дело врачей» до конца. В стране воцарилась мания преследования: люди боялись обращаться к врачам, покупать лекарства. «Дело врачей» сопровождалось откровенной антисемитской пропагандой. Готовилась депортация евреев на Дальний Восток под предлогом их спасения от гнева народа за преступления врачей-убийц. «Дело врачей» прекратилось лишь в связи со смертью Сталина.
В конце 40-х гг. тяжелые обвинения в феодально-буржуазном национализме были предъявлены национальным эпосам народов советского Востока: татарскому, калмыцкому, азербайджанскому. После этого начались увольнения и аресты писателей и ученых, изучавших прошлое своих народов. Фактически преследовалась национальная культура. По существу, это продолжало репрессивную национальную политику, развернутую еще в 1943–1944 гг., когда целый ряд народов (чеченцы, ингуши, балкарцы, калмыки, крымские татары и др.) подверглись депортации из родных мест в Казахстан и Среднюю Азию по надуманному обвинению в сотрудничестве с немецкими оккупантами. Выселяли стариков, женщин, детей. В результате депортации и тяжелых условий в местах ссылки десятки тысяч людей погибли.
Сталинская национальная политика наносила огромный вред не только репрессируемым народам, но и русскому народу, так как разжигала антирусские настроения в среде национальных меньшинств.
Борьба с «низкопоклонством и преклонением перед Западом» вызвала на рубеже 40-х — 50-х гг. ряд погромных кампаний в науке. Особенно тяжелый удар был нанесен биологии. При личной поддержке Сталина академик Т.Д. Лысенко организовал в 1948 г. сессию ВАСХНИЛ1, на которой подверглась разгрому классическая генетика. Лысенко и его сторонники, настаивая на ламаркистском принципе наследования приобретенных признаков и отрицая внутривидовую конкуренцию, шельмовали генетиков как последователей буржуазного «менделизма-морганизма» и объявляли их агентурой международного империализма в биологии. После сессии оппоненты Лысенко были изгнаны с университетских кафедр и из научных институтов, генетика была изъята из учебных программ биологических факультетов.
Зато в программы школ и вузов были включены «открытия» Т.Д. Лысенко о перерождении одних видов растений в другие под воздействием изменения условий существования, Г.М. Бошьяна о порождении вирусов микробами, О.Б. Лепешинской о возникновении клеток и тканей из «живого вещества».
Попытки организовать подобные разгромные «дискуссии» предпринимались и в других науках (например, в химии), но такого размаха, как в биологии, они не достигли.
В штыки была воспринята сталинским режимом новая область научного знания — кибернетика, объявленная буржуазной фашистской лженаукой.
Особенно беспощадно борьба с «космополитизмом» велась в общественных науках: философии, истории, литературоведении. Специалистов этих областей знания обвиняли в принижении значения русской культуры или недооценке исторических деятелей старой России.