Кафедра молекулярной биологии и медицинской биотехнологии

Отделение мед. биофизики

Павлова Г.В.

1. Стволовые клетки. Потентность стволовых клеток. Классификация стволовых клеток. Прогениторные клетки.
2. Расположение стволовых клеток в организме. Понятие ниши стволовой клетки. Описание ниш нейральных стволовых клеток.
3. Эпителиально-мезенхимальный и мезенхимально-эпителиальный переходы в онтогенезе и при патологических процессах.
4. Индуцированные плюрипотентные клетки.
5. Использование стволовых/прогениторных клеток в терапии.
6. Клеточные культуры. Контаминация клеток. Паспорт клеточных культур. Пассирование клеток. Способы консервации клеточных культур. Методы управления дифференцировкой клеток.
7. Изменчивость клеток при культивировании. Современные методы анализа изменчивости клеток при культивировании.
8. Химерные ДНК. Определение трансгеноза. Трансгенные клетки и принцип их получения. Маркирование клеток с помощью флуоресцентных белков.
9. Использование клеток для генной терапии (ex vivo). Типы векторов, используемых в генотерапии. Типы введения ДНК в клетки при генотерапии.

Титов Б.В.

1. Методы выделения ДНК и РНК из различного биологического материала.
2. Методы определения концентрации и качества полученных препаратов нуклеиновых кислот.
3. Секвенирование по Сэнгеру: принцип метода, развитие метода от радиоактивных меток до современных капиллярных секвенаторов. Задачи, которые решают с помощью секвенирования ПЦР-продуктов по Сэнгеру в медицине.
4. Фрагментный анализ ПЦР-продуктов: принцип метода, общая схема и принцип работы капиллярных секвенаторов, применение в медицинской генетической диагностике.
5. Метилирование ДНК. Методы анализа метилирования ДНК: метилчувствительная и метилспецифическая ПЦР (принцип, преимущества и недостатки), другие известные вам подходы к анализу метилирования.
6. Репарация. Способы репарации ДНК: прямое восстановление, эксцизионная репарация, репарация неспаренных нуклеотидов, негомологичное соединение концов. Ингибиторы и модификаторы различных систем репарации ДНК.
7. Молекулярно-генетическая диагностика. Характеристика STR-маркеров. Методы молекулярной цитогенетики.

Залетаев Д.В.

1. Эпигенетика, как наука. Определение эпигенетической регуляции экспрессии генов. Какие биологические явления относятся к эпигенетической регуляции. Уровни эпигенетической регуляции и их основные механизмы.

2. Механизмы метилирования ДНК и его эффекты. Пассивное и активное деметилирование ДНК. Характеристики CpG-островков. Диагностические методы определения метилирования.

3. Определение импринтинга. Нарушения импринтинга и патология у человека. Механизмы формирования однородительской дисомии. Однородительская дисомия по хромосоме 14: организация импринтированного района и фенотипические проявления.

4. Характеристики синдромов Прадера-Вилли и Ангельмана. Механизмы возникновения, способы диагностики, роль центра импринтинга.

5. Характеристики синдромов Видеманна-Беквита и Сильвера-Рассела. Механизмы возникновения, способы диагностики, роль центра импринтинга.

6. Роль метилирования/деметилирования ДНК, метилирования и ацетилирование/деацетилирование гистоновых белков в процессах канцерогенеза. Почему маркеры метилирования ДНК являются эффективным средством диагностики в онкологии.

7. Характерные черты miРНК и siРНК, их биогенез. Функции miРНК и siРНК, их участие в процессах нормального развития организма и при заболеваниях человека.

8. Циклы эпигенетического репрограммирования в онтогенезе: процессы метилирования/деметилирования ДНК, метилирования и ацетилирование/ деацетилирование гистоновых белков в пронуклеусах, бластоцисте, примордиальных герминальных клетках, гаметах. Патология импринтинга при вспомогательных репродуктивных технологиях.

9. Механизм сплайсинга. Альтернативный сплайсинг: его варианты, патологические эффекты и диагностический потенциал. Индуцированный транскрипцией сплайсинг и его патологические эффекты.

Скамров А.В.

1. Принципы конструирования векторов на примере плазмидного вектора серии PUC.

2. Введение плазмидной ДНК в клетки прокариот (трансформация клеток E.coli).

3. Встраивание фрагмента в плазмидный вектор (рестриктазы, ДНК-лигаза) и селекция клонов.

4. Общие принципы редактирования генома эукариот. Использование нуклеаз TALEN для редактирования генома.

5. Общие принципы редактирования генома эукариот. Использование нуклеаз ZFN для редактирования генома.

6. Общие принципы редактирования генома эукариот. Использование РНК-направляемых нуклеаз CRISPR/Cas для редактирования генома.