Екатерина II Манифестом от 8(19) апреля 1783 года включила Крым в состав России.
Еще в конце 1782 года в Ахти-арской бухте остались на зимовку два корабля: «Храбрый» и «Осторожный», а сразу после подписания Манифеста Екатерины, в бухту входит уже целая эскадра под командованием вице-адмирала Ф.А. Клокачева. С закладки первых домов 3 (14) июня 1783 года началась история города Севастополя.
Название городу было присвоено Указом Екатерины II от 10 февраля 1784 года.
Севастополь был основан как главная база Черноморского флота (хотя этот статус город получил позднее) и как военная крепость.
В начале 1787 года по инициативе Г.А. Потемкина, Екатерина II, в сопровождении австрийского императора Иосифа II, множества иностранных послов и министров совершила поездку по вновь завоеванным землям. Конечной точкой этой пропагандистской экспедиции стал Севастополь. К этому времени город и флот разрослись настолько, что повергли иностранных наблюдателей в шок, а Екатерине доставили глубокое удовлетворение.
Однако, увиденное заставило западных политиков с удвоенной силой подталкивать Турцию к новой войне с Россией. Они справедливо рассудили, что если не остановить Россию сейчас, то скоро ее мощь на южных рубежах станет несокрушимой. 13 сентября 1787 года, спустя 3 месяца после отъезда Екатерины из Севастополя, русский посол в Стамбуле был посажен в тюрьму Семибашенного замка, а России объявлена война.
В ходе русско-турецкой войны (1787-1791 г.г.), Севастопольская эскадра получила первое боевое крещение. Под командованием легендарного адмирала Ф.Ф. Ушакова русские моряки выиграли морские сражения у острова Фидониси, у Тендровской косы и при Калиакрии. Тем временем сухопутная армия под командованием А.В. Суворова в 1791 году взяла неприступную крепость Измаил.
В течение последних лет войны (1790-1791 г.г.) Черноморский флот не потерял ни одного корабля и ни одного человека. В рапортах Ушакова, отправляемых главнокомандующему Г.А. Потемкину, неизменно делалась пометка: «Благополучный Севастополь».
Война закончилась победой России: 29 декабря 1791 г. (9 января 1792 г.) был подписан Ясский мирный договор. Турция подтвердила условия Кючук-Кайнарджийского мира и признала присоединение Крыма к России. К победителям отошли земли от Южного Буга до Днестра. Проливы Босфор и Дарданеллы были вновь открыты для прохода русских судов.
Во время войны в устье Южного Буга был основан г. Николаев - новый центр российского кораблестроения на Черном море. До 1834 года здесь находилась и резиденция командующего флотом.
В конце XVIII века, под руководством Ф.Ф. Ушакова, Севастополь переживал первый в своей истории строительный бум. К 1800-му году в городе был водопровод, госпиталь на 300 человек, адмиралтейство (прообраз будущего Морского завода), парк в Ушаковой балке на Корабельной стороне. Население, включая военнослужащих, достигло 30.000 человек, и Севастополь стал самым большим городом в Крыму.
В 1804 году сюда была переведена главная база Черноморского флота, а в 1809 году город был офи циально объявлен военной крепостью. Командующий флотом с 1805 года являлся одновременно военным губернатором Севастополя и Николаева. С этого момента Севастополь не входил в состав Таврической губернии и впервые в своей истории получил особый статус.
В 1797 году, в правление Павла I, который ненавидел все, что было связано с его матерью, город был переименован в Ахтиар5. При Александре I (1801-1825 г.г.) употреблялись оба названия города. Николай I в 1826 году повелел впредь именовать город только Севастополем, а слово Ахтиар не употреблять.
Во время наполеоновских войн (в 1798-1800 г.г.) русская эскадра под командованием Ф.Ф. Ушакова, в союзе с турецким и английским флотами, участвовала в боях на Средиземном море против наполеоновской Франции. На счету русских моряков - блестящая победа у острова Корфу, изгнание французов из Италии и другие громкие победы.
На освобожденных от французов греческих Ионических островах адмирал Ушаков создал Ионическую Республику, и даже написал для нее конституцию. Впервые в Новой истории греки получили свое, пусть и небольшое, независимое государство, и получили они его из рук русского адмирала. Остальная часть Греции продолжала томиться под турецким игом. Однако, союзнические отношения России и Турции, объединившихся против общего врага — революционной Франции, были недолгими. Многочисленные острые противоречия толкали старых конкурентов к войне. Дважды в первой половине XIX века Османская и Российская империи сходились в смертельных схватках - в 1806-1812 и 1828-1829 годах.
Бои шли на кавказском театре военных действий, а Черноморский флот участвовал лишь в локальных операциях. Во время войны 1828-1829 года совершил свой подвиг бриг «Меркурий», который во время блокирования Черноморским флотом Босфора наткнулся в одиночку на турецкую эскадру. Два линейных корабля погнались за «легкой добычей», но неравный бой закончился победой «Меркурия». Несмотря на множество пробоин, «Меркурий» остался на плаву, присоединился к остальным силам флота и своим ходом вернулся в Севастополь.
В честь подвига брига и его командира А.И. Казарского по проекту академика архитектуры А.П. Брюллова в Севастополе был установлен первый памятник.
Двумя годами раньше силы русского флота в союзе с Англией и Францией приняли участие в войне за освобождение Греции. 8 октября 1827 года в Наваринской бухте (на юге Греции) состоялось сражение, в котором союзным силам противостоял турецко-египетский флот.
В этой знаменитой битве, открывшей греческому народу путь к свободе, принимал участие линейный корабль «Азов», уничтоживший пять турецких судов, в том числе, два флагманских. Командовал кораблем капитан I ранга М.П. Лазарев, а в составе его экипажа были будущие герои Первой обороны Севастополя лейтенант П.С. Нахимов, мичман В.А. Корнилов и гардемарин (курсант) В.И. Истомин.
Тем временем Севастополь продолжал жить и развиваться. Аристократические кварталы, в которых жили адмиралы и офицеры флота, окружали все более разраставшиеся слободки бедноты — отставных матросов, беглых крестьян, мастеровых и работных людей. Трудности жизни в городе, оторванном от центра России на тысячи километров, сказывались на них прежде всего.
В 1829 году в Причерноморье вспыхнула эпидемия чумы. Были развернуты карантины, подвоз продовольствия почти прекратился, цены взлетели вверх, а военно-полицейский резким в Севастополе стал совершенно невыносимым. В результате, зимой 1830 года вспыхнуло восстание доведенной до отчаяния севастопольской бедноты. В истории оно получило название «чумного бунта». Восставшие пятеро суток удерживали власть в городе. Бунт был очень жестоко подавлен: семеро повстанцев расстреляны, несколько сот прогнаны сквозь строй и сосланы на каторгу. Среди осужденных было более 400 женщин, а 150 детей повстанцев распределили по приютам.
Однако, это событие помогло вернуть внимание правительства к городу и флоту. С 1832 года, когда Михаил Петрович Лазарев был назначен начальником штаба, а с 1834 года - главным командиром (коман- дующим) Черноморского флота, начинается новый этап бурного роста Севастополя.
В течение 1835-1853 г.г. население города увеличилось до 50.000 человек. Было возведено пять мощных каменных фортов для защиты от атаки с моря, два из которых, Михайловский и Константиновскии, сохранились до сих пор. Город обретает присущую ему и сейчас планировку и классический архитектурный стиль. По проектам архитекторов В.А. Рулева и Джона Уптона (английского инженера на русской службе) возводятся известнейшие архитектурные памятники: колоннада Графской пристани, Петропаловский собор, Морская библиотека. В городе появляется каменное здание первого театра.
Застраивается красивыми домами так называемый «Хребет беззакония» - былое царство трущоб, рассадник заразы и преступности, известный нам теперь как Центральный или Городской холм. Возводится новое Адмиралтейство, в составе которого появляются уникальные сухие доки. Воду к ним подвели из р. Черной по водопроводу, от которого сохранились акведуки в устьях Ушаковой и Аполлоновой балок.
В составе Черноморского флота появились первые пароходы. Россия
активно готовилась к продолжению своей наступательной политики в Черноморском и Средиземноморском регионах.
Русское правительство никогда не забывало о главной цели: при благоприятных обстоятельствах захватить контроль над проливами Босфор и Дарданеллы - ключом от Черного моря. Однако, это стремление наталкивалось на сопротивление не только Турции, но и Англии, и Франции, которые проводили в Восточном Средиземноморье собственную политику и не могли допустить усиления влияния России.
Этот регион приобретал ключевое значение в связи с начинавшимся строительством Суэцкого канала, открывавшего прямой путь к Индии и другим английским колониям в Азии. Поэтому, каждая из европейских держав стремилась установить контроль над Балканами и не допустить к этому конкурентов.
Россия в конфликтах с Турцией постоянно преследовала еще одну важнейшую для нее цель: освобождение братских славянских народов (болгар, сербов, македонцев, черногорцев) и православных молдаван и валахов от турецкого ига.