В летопись Великой Отечественной войны вошли подвиги защитников Аджимушкая, с мая по октябрь 1942 г. державших оборону в каменоломнях в тылу врага, героизм десантников Керченско-Феодосийской операции 1941 г. и Эльтигенской операции 1943 г. 11 апреля 1944 г. Керчь был освобожден. За время боёв в Керчи было уничтожено более 85 % зданий, освободителей встретили чуть более 30 жителей города из почти 100 тысяч жителей 1940 г. За героизм, мужество и заслуги населения и подвиги воинов в Великой Отечественной войне, городу Керчи присвоено звание города-героя.
Керчь – древний город, стоящий меж двух морей – Черного и Азовского. Не однажды приходилось ему играть важную роль в истории, не раз и не два он, казалось, погибал, но снова на обугленных руинах рождалась жизнь.
Летом 1941 года сюда пришла война. 17 ноября 1941 года гитлеровцы в первый раз захватили город. Насаждение своей власти в Керчи захватчики начали с массового истребления мирных жителей и в первую очередь - женщин, стариков, детей. В течение трех дней в конце ноября 1941 года вблизи деревни Багерово фашистами было расстреляно свыше 7 тысяч керчан. «Багеровский ров» - именно отсюда начала свою работу Советская комиссия по расследованию преступлений фашизма. Материалы этого расследования были представлены на Нюрнбергском процессе. 
Аджимушкай! Название мало кому известного поселка стало синонимом слова «подвиг». Не одну сотню лет здесь, в Аджимушкае, добывали известняк-ракушечник, из которого строился город. В результате образовались подземные лабиринты большой протяженности. Именно они и стали надежным убежищем не только местным жителям, но и бригадам народного ополчения, базам партизанских отрядов.
В одном из донесений оккупационного командования «О советском движении сопротивления в каменоломнях Аджимушкая» сказано: «От командующего русским фронтом в Крыму генерал-лейтенанта Козлова полковник Ягунов получил приказ продержаться до возвращения Красной Армии. Этот приказ точно выполнялся…». Он мог читаться и выполняться только однозначно: драться с врагом в его тылу. Подземный гарнизон Аджимушкая – несколько тысяч бойцов и командиров Красной Армии, местных жителей-керчан во главе с полковником П.М. Ягуновым – своими неожиданными атаками наводил ужас на захватчиков, заставлял держать в этом районе большое количество войск и боевой техники, которых так не хватало фашистским генералам на передовой.
Гитлеровцы неоднократно пытались уничтожить Подземный гарнизон. Они взрывали входы и выходы из подземелий, забрасывали дымовые шашки, накачивали компрессорами отравляющий газ. Много бойцов и командиров погибло в дни газовых атак, но, когда гитлеровцы попытались сунуться в катакомбы, считая, что подземный гарнизон сломлен, их, как и прежде, встретили огнем. На Большую землю понеслись слова радиограммы, подписанной полковником П.М. Ягуновым: "Всем! Всем! Всем! Всем народам Советского Союза! Мы, защитники обороны Керчи, задыхаемся от газа, умираем, но в плен не сдаемся!"
С мая до конца октября 1942 года сражался с врагом Подземный гарнизон, 170 дней и ночей. В условиях недостатка свежего воздуха, продовольствия, воды, боеприпасов, ежедневных газовых атак фашистов, войска, укрывшиеся в Аджимушкайских катакомбах, всеми средствами выполняли свою главную задачу – наносить урон врагу. К сентябрю 1942 г. в каменоломнях оставалось не более 300 человек. Но все равно эта частица земли оставалась неподвластной оккупантам…
Осенью 1943 г. войскам 18-й армии (командующий - генерал-лейтенант К.Н.Леселидзе) была поставлена, задача во взаимодействии с 56-й армией захватить, плацдарм в районе рыбацкого поселка Эльтигена, расширить его, взять под контроль Камышбурунский порт и далее наступать в глубь Керченского полуострова в обход Керчи.
Гитлеровцы, подтянув резервы, обрушились на защитников плацдарма, стремясь, во что бы то ни стало сбросить их в море. Тридцать шесть суток в условиях морской блокады, под постоянным огнем противника, сражались эльтигенские десантники.
Подвиг участников десанта положил начало освобождению Керчи и всего Крыма. За бои на Эльтигенском плацдарме 61 человек был удостоен звания Героя Советского Союза.
Бои за Керчь были жестокими. Весенним утром 11 апреля 1944 года полуживой город, в котором насчитывалось несколько уцелевших зданий и лишь несколько десятков жителей, снова стал свободным. Остатки разбитых фашистских войск спасались бегством.
В первый день свободы группа воинов, освобождавших Керчь, шла по разрушенным улицам города и вдруг увидела, как старик по приставной лестнице взбирается на ворота своего дома. Он сорвал с них табличку с немецким названием улицы, а потом достал из-за пазухи красный флаг и прикрепил его к воротам. Он пронес его через все ужасы оккупации, веря, что настанет час, когда флаг можно будет открыто, не таясь, поднять над домом.
И этот час настал весной…