Сброс в реку Сырдарья коллекторно-дренажных вод с орошаемых территорий, сточных вод населенных пунктов и размещение в водоохранной зоне рек различного рода загрязнителей, способствуют увеличение степени химического и бактериального загрязнения поверхностных и подземных вод.
Использование воды для рекреации, орошения и особенно для питьевых нужд стало опасным, увеличилась численность заболевания. В почве, орошаемой водой р.Сырдарья, установлено присутствие бензипирена.
Особое напряженное положение в последние годы отмечается в связи с резким ухудшением качества воды малых рек Ферганской долины (Касансай, Падша-Ата, Исфайрам, Сох, Исфара, Ахангаран, Чирчик). В последние 15-20 лет имеет место высокий рост численности населения в этом регионе, и, как правило, народонаселение осуществлялось в долинах вышеуказанных рек, что привело к резкому увеличению нагрузки на экологическое состояние природных и водных объектов. Почти все сточные воды населенных пунктов из этого региона без очистки сбрасываются в реки, тем самым, создавая сложную санитарно-эпидемиологическую обстановку.
В соответствии с этим изменился гидрологический, гидрохимический режим рек. Весь этот неполноценный сток реки средней части долин вторично начал изыматься для орошения уже в верхней части их нижнего течения. В результате в собственно нижнем течении природный сток перестал поступать. Русло реки здесь стало главным приемником дренажного и сбросного стока. Примером могут служить верхнее и среднее течения рек Сырдарьи, Карадарьи и Нарына и уже сама река Сырдарья почти до створа Шардаринской плотины является единственным водоприемником дренажных и сточных вод, так как других водоприемников, по сути, отсутствуют.
Интенсивное зарегулирование поверхностного стока р.Сырдарьи резко ухудшило условия ее самоочищения в результате существенного изменения гидрологического режима в среднем и особенно в нижнем течении.
Качество воды реки Сырдарья и Аральского моря за 2016 год согласно данным химико-аналитических лаборатории Южно-Казахстанской и Кызылординской областей приведено в таблице 6.2.1.
Концентрация сульфатов и меди наблюдаются по всей длине реки Сырдарья и в Аральском море. В верховье реки Сырдарья, на территории ЮКО, в воде наблюдаются азот нитритный, фенолы, магний.
Кызылординская область. Наблюдения за загрязнением поверхностных вод на территории Кызылординской области проводились на 2 водных объектах в реке Сырдарья и Аральском море.
В реке Сырдария среднее значение водородного показателя составило – 7,99, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем составляла 6,93мг/дм3, БПК5 в среднем 1,07 мг/дм3.
Превышения ПДК были зафиксированы по веществам из групп тяжелых металлов (медь - 2,4 ПДК,) и главных ионов (сульфаты - 4,4 ПДК,).
В Аральском море водородный показатель – 8,13, концентрация растворенного в воде кислорода составила 6,77мг/дм3, БПК5–1,0 мг/дм3.
Превышения ПДК были зафиксированы по веществам из групп тяжелых металлов (медь - 3,0 ПДК,), главных ионов (сульфаты - 4,4 ПДК).
Качество воды водных объектов на территории Кызылординской области оценивается следующим образом: река Сырдария и Аральское море - «высокого уровня загрязнения ».
По сравнении с 2015 годом качество воды реки Сырдария и Аральского моря не ухудшалось.
Южно-Казахстанская область. Наблюдения за загрязнением поверхностных вод на территории Южно-Казахстанской области проводились на 7-и водных объектах (реки Сырдария, Келес, Бадам, Арыс, Боген, Катта - Бугунь и водохранилище Шардаринское).
В реке Сырдария – среднее значение водородного показателя –8,01, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем 10,1 мг/дм3, БПК5 в среднем 1,96 мг/дм3. Превышения ПДК были зафиксированы по веществам из групп главных ионов (сульфаты –5,1 ПДК, магний –1,5 ПДК), биогенных веществ (азот нитритный –3,1 ПДК), тяжелых металлов (медь –1,5 ПДК) и органических веществ (фенолы –1,9 ПДК).
В реке Келес –среднее значение водородного показателя – 8,1, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем 10,6 мг/дм3, БПК5 в среднем 1,62 мг/дм3. Превышения ПДК были зафиксированы по веществам из групп главных ионов (сульфаты –5,8 ПДК, магний – 1,6 ПДК), биогенных веществ (азот нитритный –1,5 ПДК), тяжелых металлов (медь –1,4 ПДК) и органических веществ (фенолы –2,1 ПДК).
В реке Бадам –среднее значение водородного показателя 7,99, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем 9,98 мг/дм3, БПК5 в среднем 1,99 мг/дм3. Превышения ПДК были зафиксированы по веществам из групп главных ионов (сульфаты – 1,7 ПДК), биогенных веществ (азот нитритный –1,6 ПДК) и органических веществ (фенолы –1,2 ПДК).
В реке Арыс – среднее значение водородного показателя 7,93, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем 9,30 мг/дм3, БПК5 в среднем 1,45 мг/дм3. Превышения ПДК были зафиксированы по веществам из групп главных ионов (сульфаты –1,5 ПДК), биогенных веществ (азот нитритный –1,1 ПДК), тяжелых металлов (медь –1,2 ПДК) и органических веществ (фенолы– 1,7 ПДК).
В реке Боген – среднее значение водородного показателя 8,29, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем 9,94 мг/дм3, БПК5 в среднем 1,59 мг/дм3. Превышения ПДК были зафиксированы по веществу из группы органических веществ (фенолы –1,2 ПДК).
В реке Катта - Бугунь –среднее значение водородного показателя 7,91, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем 9,61 мг/дм3, БПК5 в среднем 1,69 мг/дм3. Превышений ПДК не наблюдались.
В водохранилище Шардара –среднее значение водородного показателя 8,05, концентрация растворенного в воде кислорода в среднем 10,9 мг/дм3, БПК5 в среднем 2,28 мг/дм3. Превышения ПДК были зафиксированы по веществам из групп главных ионов (сульфаты–5,4 ПДК, магний –1,5 ПДК), биогенных веществ (азот нитритный –1,8 ПДК), тяжелых металлов (медь –1,3 ПДК) и органических веществ (фенолы –2,5 ПДК).
Качество воды водных объектов на территории Южно-Казахстанской области оценивается следующим образом:
вода «нормативно чистая» - река Катта - Бугунь;
вода «умеренного уровня загрязнения» - реки Сырдария, Келес, Бадам, Арыс, Боген и вдхр. Шардара.
В сравнении с 2015 годом качество воды рек Сырдария, Келес, Бадам, Арыс, Катта-Бугунь и вдхр. Шардара - существенно не изменилось; река Боген - ухудшилось.