2. 2.
Джексон, Л.А. и др. Вакцина на основе мРНК против SARS-CoV-2 - предварительный отчет. N. Engl. J. Med. 383, 1920–1931 (2020).
CAS Статья Google ученый
3. 3.
Xia, S. et al. Безопасность и иммуногенность инактивированной вакцины против SARS-CoV-2, BBIBP-CorV: рандомизированное двойное слепое плацебо-контролируемое исследование 1/2 фазы. Lancet Infect. Дис. 21. С. 39–51 (2021).
CAS Статья Google ученый
4. 4.
Ramasamy, MN et al. Безопасность и иммуногенность вакцины ChAdOx1 nCoV-19, вводимой в режиме первичной бустерной вакцинации у молодых и пожилых людей (COV002): одинарное слепое рандомизированное контролируемое исследование фазы 2/3. Ланцет 396, 1979–1993 (2020).
CAS Статья Google ученый
5. 5.
Xia, S. et al. Влияние инактивированной вакцины против SARS-CoV-2 на безопасность и иммуногенность: промежуточный анализ 2 рандомизированных клинических испытаний. Варенье. Med. Доц. 324, 951–960 (2020).
CAS Статья Google ученый
6. 6.
Meckiff, BJ et al. Дисбаланс регуляторных и цитотоксических SARS-CoV-2-реактивных CD4 (+) Т-клеток при COVID-19. Cell 183, 1340–1353.e16 (2020).
CAS Статья Google ученый
7. 7.
Ren, X. et al. Особенности иммунитета COVID-19, выявленные в крупномасштабном атласе одноклеточного транскриптома. Ячейка https://doi.org/10.1016/j.cell.2021.01.053(2021 г.).
8. 8.
Bernardes, JP et al. Лонгитюдный многопрофильный анализ идентифицирует реакцию мегакариоцитов, эритроидных клеток и плазмобластов как отличительные признаки тяжелой формы COVID-19. Иммунитет 53, 1296–1314.e99 (2020).
CAS Статья Google ученый
9. 9.
Su, Y. et al. Multi-Omics решает проблему резкого сдвига болезненного состояния между легкой и умеренной формой COVID-19. Cell 183, 1479–1495.e20 (2020).
CAS Статья Google ученый
10.10.
Wen, W. et al. Профилирование иммунных клеток пациентов с COVID-19 на стадии выздоровления с помощью одноклеточного секвенирования. Cell Discov. 6, 31 (2020).
CAS Статья Google ученый
11.11.
Heming, M. et al. Неврологические проявления COVID-19 включают истощение Т-лимфоцитов и дедифференцированные моноциты в спинномозговой жидкости. Иммунитет 54, 164–175.e6 (2021).
CAS Статья Google ученый
12.12.
Flament, H. et al. Результат инфекции SARS-CoV-2 связан с активацией клеток MAIT и цитотоксичностью. Nat. Иммунол. 22, 322–335 (2021).
CAS Статья Google ученый
13.13.
Hadjadj, J. et al. Нарушение активности интерферона I типа и воспалительные реакции у пациентов с тяжелой формой COVID-19. Science 369, 718–724 (2020).
CAS Статья Google ученый
14.14.
Kusnadi, A. et al. У тяжелобольных пациентов с COVID-19 наблюдается нарушение функций истощения в отношении SARS-CoV-2-реактивных CD8 (+) Т-клеток. Sci. Иммунол. 6, https://doi.org/10.1126/sciimmunol.abe4782 (2021 г.).
15.15.
Кариссимо, Г. и др. Иммунофенотипирование цельной крови позволяет выявить соотношение незрелых нейтрофилов и Т-клеток VD2 в качестве раннего маркера тяжелой формы COVID-19. Nat. Commun. 11, 5243 (2020).
CAS Статья Google ученый
16.16.
Guan, WJ et al. Клиническая характеристика коронавирусной болезни 2019 г. в Китае. N. Engl. J. Med. 382, 1708–1720 (2020).
CAS Статья Google ученый
17.17.
Huang, C. et al. Клинические особенности пациентов, инфицированных новым коронавирусом 2019 г., в Ухане, Китай. Ланцет 395, 497–506 (2020).
CAS Статья Google ученый
18.18.
Лау, EHY et al. Титры нейтрализующих антител при инфекциях SARS-CoV-2. Nat. Commun. 12, 63 (2021 г.).
CAS Статья Google ученый
19.19.
Lim, S., Bae, JH, Kwon, HS & Nauck, MA COVID-19 и сахарный диабет: от патофизиологии к клиническому ведению. Nat. Rev. Endocrinol. 17, 11–30 (2021).
CAS Статья Google ученый
20.20.
Codo, AC et al. Повышенные уровни глюкозы способствуют инфицированию SARS-CoV-2 и ответу моноцитов через HIF-1альфа / гликолиз-зависимую ось. Cell Metab. 32, 437–446.e5 (2020).
CAS Статья Google ученый
21.21.
Липпи, Г., Саут, А.М. и Генри, Б.М. Электролитный дисбаланс у пациентов с тяжелой формой коронавирусной болезни 2019 г. (COVID-19). Анна. Clin. Biochem. 57 год, 262–265 (2020).
CAS Статья Google ученый
22.22.
Zhang, Y. et al. Коагулопатия и антифосфолипидные антитела у пациентов с Covid-19. N. Engl. J. Med. 382, e38 (2020).
Статья Google ученый
23.23.
Becht, E. et al. Снижение размерности для визуализации данных с одной ячейкой с использованием UMAP. Nat. Biotechnol. https://doi.org/10.1038/nbt.4314 (2018).
24.24.
Aran, D. et al. Референсный анализ секвенирования одноклеточных клеток легких показывает переходный профибротический макрофаг. Nat. Иммунол. 20. С. 163–172 (2019).
CAS Статья Google ученый
25.25.
Корсунский, И. и др. Быстрая, чувствительная и точная интеграция данных отдельных ячеек с Harmony. Nat. Методы 16 2019. С. 1289–1296.
CAS Статья Google ученый
26.26.
Crowell, HL et al. muscat обнаруживает переходы между состояниями, специфичными для субпопуляций, на основе данных транскриптомики одной клетки с несколькими выборками и несколькими условиями. Nat. Commun. 11, 6077 (2020).
CAS Статья Google ученый
27.27.
Baran, Y. et al. MetaCell: анализ одноклеточных данных РНК-seq с использованием разделов графа K-nn. Genome Biol. 20, 206 (2019).
Статья Google ученый
28.28.
Ван де Санде, Б. и др. Масштабируемый рабочий процесс SCENIC для анализа регуляторной сети отдельных клеток. Nat. Protoc. 15. С. 2247–2276 (2020).
Статья Google ученый
29.29.
Aibar, S. et al. SCENIC: вывод и кластеризация одноячеечной регуляторной сети. Nat. Методы 14 2017. С. 1083–1086.