По дороге, в степи Малик, Наследный принц встретился с представителем российской Императорской власти – генерал-лейтенантом Михаилом Николаевичем Анненковым (1835-1899), представителем военного ведомства Российской Империи в Министерстве путей сообщения.
Генерал заверил Монарха, что в случае возникновения каких-либо политических осложнений из-за возможных претензий других Державных сыновей почившего Эмира Сайида Музаффаруддина Бахадур Хана на престол государства, Эмир Сайид Абдул Ахад Бахадур Хан, несомненно, может рассчитывать на помощь Российской Империи.
Молитва и восшествие на престол.
Прежде чем въехать в столицу страны город Бухара, новый Эмир посетил мазар (место поклонения) – гробницу основателя суфийского ордена накшбанди - самого влиятельного в Эмирате Бухара и Кокандском Ханстве Ходжи Мухаммада ибн Мухаммада ал-Бухари шейха Бахааддина шах-и накшбанда (1318-1389), что расположена в селении Бахауддин в 9-ти км к северо-востоку от города Бухара, где совершил молитву.
В тот же день скорбящий Державный сын участвовал в похоронах Августейшего родителя, а 31 октября (13 ноября) 1885 года в бухарской крепости (арке) состоялась торжественная церемония поднятия Эмира на кошме – ковре из верблюжьей шерсти.
Так официально взошел на престол новый Государь Бухары. Началось долгое правление предпоследнего Эмира Благородной Бухары, ознаменовавшееся многими важными событиями и изменениями в жизни Эмирата.
Правление Монарха.
Первые годы своего Царствования Эмир вынужден был пребывать в столице своего государства, дабы утвердить власть и обрести верность народа.
Однако в самой Бухаре Монарх проводил не более полугода, зимой уезжая обыкновенно на несколько месяцев в поселения Шахрисабз – городе, расположенном в 80-ти км. к югу от города Самарканд, являющемся родиной Тамерлана (Тимура) (1336-1405), где расположены руины его Дворца и усыпальница великого завоевателя, а также мечеть Кок-Гумбез и комплекс мавзолеев Гумбези-Сейидан.
Другим любимым городом Эмира был Карши (Насаф), расположенный в южной части Эмирата, в левобережной части долины реки Кашкадарьи, в центре Каршинского оазиса, в месте рождения Зийа ад-Дин Нахшаби́ (ум. 1350), знаменитого индийского врача, философа, богослова, автора помимо прочего двух мистических трактатов суфизма.
В июне и июле Эмир проживал в любимом им городе Кермине, а возвращаясь в Бухару, Государь обычно останавливался не в крепости Бухара, а в своем загородном Дворце Ширбудун.
На девятом году Царствования, в 1894 году, рассорившись с бухарским духовенством, Эмир поселился в г. Кермине и никогда более, до самой кончины, не возвращался в столицу страны город Бухара.
Эмир-миротворец.
При Эмире Сайид Абдул Ахад Бахадур Хане в Бухарском Эмирате отменены были все пытки и ограничены смертные казни.
Самые жестокие виды из них, к примеру, сбрасывание осужденного с самого высокого в Бухаре минарета Калян (Минарайи Калан), построенного в 1124 г., Монарх запретил навсегда.
Государь-реформатор.
Государь Бухары начал в Эмирате промышленную добычу полезных ископаемых: меди, железа и золота, привлекая иностранные капиталы и рабочих.
С ведома и при активной помощи Государя в Эмирате проложены были железные дороги и телеграфные линии, бурно развивалась торговля.
Эмир лично и весьма деятельно участвовал в торговле каракулем, занимая третье место на мировом рынке по объему торговых операций с этим ценным мехом.
По некоторым данным, на личных счетах Эмира только в Российском Императорском государственном банке хранилась огромная сумма – около 27 миллионов рублей золотом, при этом еще около 7 миллионов – в частных коммерческих банках Российской Империи.
Благотворительность Монарха.
Все русские авторы, писавшие об Эмире, отмечали активную благотворительную деятельность Государя.
Так, в 1892 году Эмир пожертвовал 100 тысяч рублей золотом для пострадавших от бедствий в различных областях Российской Империи.
В 1904 году, во время Русско-японской войны, Государь выделил 1 миллион рублей золотом на нужды Русского Императорского флота.
Оказывал Эмир материальную помощь и 5-му Оренбургскому казачьему полку, шефом которого Государь являлся.
Монарх также подарил несколько древних золотых монет для коллекции Туркестанского археологического кружка.
Преобразователь армии.
Большое внимание Эмир Сайид Абдул Ахад Бахадур Хан уделял вооруженным силам своего государства.
Еще в молодые годы, будучи беком (властелином) в г. Кермине, Наследный принц лично занимался муштровкой своего гарнизона, а потому содержал керминскую крепость в отличном состоянии, что отмечали навещавшие его русские офицеры.
Во время одного из таких визитов Эмир пожелал видеть построение казачьего конвоя, сопровождавшего русское Императорское посольство, имея в виду перенять русский опыт.
Возвращаясь из очередной поездки в Российскую Империю в 1893 году, в г. Ашхабад Эмир увидел туркменскую милицию, обученную русскими и ни в чем не уступавшую по выучке казакам. Именно тогда, по его собственным словам, Монарху пришла в голову мысль о необходимости реорганизации бухарской армии, которую Государь и осуществил, два года спустя.
В дальнейшем Эмир делал многое для улучшения военной подготовки и вооружения своего войска: например, в обход решений российского Императорского правительства, наложившего ограничения на поставки в Эмират Бухара стрелкового оружия, Эмир покупал винтовки для своих солдат через русских купцов.