Эмбриологические свидетельства эволюции
•Цифровые, а не аналоговые программы
ДНК – цифровая, а не аналоговая запись, можно прочесть по ней аминокислотную последовательность, если таковая имеется, но нельзя сразу определить, что она делает.
–адекватные мутации невозможны, рука, крыло, глаз не могут возникнуть сразу
•Нет генерального плана, есть локальные правила
•Нецелесообразные, но сходные пути органогенеза
Эмбрионы Геккеля. На стадиях органогенеза эмбрионы позвоночных проходят схожие пути, закладки органов. Но не совсем на ранних стадиях. На стадиях бластул итд они очень сильно отличаются. Затем в начале органогенеза сходство, со временем сменяющееся различием.
Зачем человеку сходств, если он потом подвергается апоптозу. Зачем дельфину почка задних конечностей.
Примеров, опровергающих эволюцию, в эмбриогенезе нет. (Правда, Бородин оценил идею Владыко про гипотетических видов в пределах одной группы, которые начинают с разных исходных точек, а потом конвергируют – ХЗ, что имели в виду, давайте тогда к любому доказательству придумывать гипотетические исключения. Хрень, короче.)
•Различия взрослых форм обусловлены небольшими изменениями программ развития
•Descent with modifications
Молекулярные свидетельства эволюции
•Единство способов хранения и передачи ген. информации – ДНК, РНК. Даже если кто-то прилетел и создал все на Земле, то или это было один раз, или было много раз, но выжили организмы из одного заноса, или же было много раз, но все из одного места, где, в свою очередь, единожды возникла жизнь. Потому что имеем один и тот же код, который ни из чего не следует. Он не является обязательным, он не самый лучший, не самый оптимальный, можно было бы создать код и получше. Но как только он возник, его уже нельзя поменять.
•Универсальность и вырожденность кода
Это все и так знают.
•Замусоренность геномов:
–ретровирусы, повторы, псевдогены
•Сходство нейтральных участков геномов параллельно внешнему сходству
Касаются не только функциональных частей, (что объяснимо функциональной пользой), но и нейтральных. Это полезно при построении деревьев.
•Descent with modifications
Берем голубей. Одна-единственная замена нуклеотида дает совершенно новую прическу. На уровне ДНК это вовсе не очевидно.
У разных организмов есть консервативные последовательности, которые вообще-то могли бы меняться как угодно, если бы не поддерживались естественным отбором, то есть, изменения их способствуют отсеву организмов. Тем не менее, в геноме человека много мусора, экзом составляет всего 2%. Но ENCODE установил, что функции имеет 80,4 % генома. Что же считать функцией? ENCODE считал, что если последовательность транскрибируется, имеет рамки считывания, регуляторные элементы, значит она имеет функцию. Тогда 74,7 % генома транскрибируется, 56,1% имеет открытые рамки считывания. Но так-то логика не совсем верная. Сердце имеет прикольную форму – тоже функция, но ненужная. Нужная – что эта форма включает клапаны и вообще может качать кровь, вот эта функция будет поддерживаться отбором. То же и с ДНК – ну и что, что транскрибируется. Реплицируется вон вообще 100% ДНК, это же не значит, что мусорной вообще нет. Нужная ДНК – только та, которая консервативна (именно ~2%), потому что изменения в ней ухудшают шансы организма пройти отбор, любая другая – мусор. Геном не может оставаться неизменным 50-100 млн лет, миллиарды, если речь идет о рибосомальной РНК если его не проверяют.
Есть мусор – хлам, который бесполезен, но и безвреден, и есть постольку, поскольку появляется быстрее, чем мы от него успеваем отделываться. Когда ДНК становится вредной, тогда она уже удаляется.
Сначала началось все с молекул РНК. Это не жизнь. Просто они могут создавать свои точные копии. Они обладают наследственностью (воспроизводят себя), способностью к катализу, способность принимать двуцепочечную форму, сложные формы. Это случайный процесс, но если она катализирует хоть что-то, повышающее шансы репликации молекулы, это уже другое дело.
Но складывается она при пониженной температуре, а для репликации нужен отжиг – противоречие. В черных курильщиках: есть капиллярные структуры, внизу повышенная температура, вверху – около 4 градусов.
Метод научного тыка в фармакологии – кучу разных умеренно длинных рнк выливают в колонку, нужная задерживается на необходимом субстрате, затем в неё вносятся различные мутации и снова отбирается лучшая. В итоге, имеем наиболее эффективные факторы связывания к нашему субстрату. Стр 39.
Цели у этих молекул не было, мы запланированы не были. Нельзя создать то, что будет хорошо в будущем, но не нужна или вредна сейчас. Выгодно именно сейчас присоединение кофактора – присоединили, лучше работается в паре – рибозимы объединяются. Вообще в этой версии развития молекул в жизнь Павел Михайлович делал много допущений и проскоков.
Вторая версия возникновения кода (которая нравится Бородину меньше) в том, что аминокислоты группируются по своим свойствам, и сначала прямо на молекуле РНК без рибосом и рибозимов происходила полимеризация АМК для оптимизации всей конструкции. Но это сложнее.
ДНК эгоистична. Мы – просто машина выживания ДНК. Жизнь – конкуренция репликаторов.
Мусорная ДНК со временем может стать полезной. Теломерные последовательности дрозофил – на самом деле ретровирусные последовательности.