В начале 1918 г. по поручению В.И. Ленина центральные органы советской власти начинают устанавливать первые рабочие контакты с Российской Академией наук (РАН), которую в мае 1917 г. возглавил первый выборный президент, известный русский геолог академик А.П. Карпинский. В середине марта 1918 г. Совнарком и Наркомпрос РСФСР запросили президента Академии наук, какую роль в решении научных задач социалистического строительства могли бы сыграть сама РАН и особенно ее Комиссия по изучению естественных производительных сил России (КЕПС), созданная царским правительством в октябре 1915 г. по предложению ряда видных академиков, в том числе В.И. Вернадского, Н.И. Андрусова, Б.Б. Голицына, А.Н. Крылова, Н.С. Курнакова, А.Е. Ферсмана и других.
В конце марта 1918 г. совет Комиссии под председательством В.И. Вернадского сообщил А.П. Карпинскому о своей полной готовности начать работу по заданию советского правительства. Вскоре Наркомпрос РСФСР утвердил ее смету на сумму 780 тыс. рублей, которой предусматривалось создание 5 больших научных коллегий и 2 новых научных институтов — Института физико-химического анализа и Института по изучению платины и других благородных металлов.
Через месяц в составе КЕПС было создано не 5 коллегий, а 20 отделов: по изучению почвы; по промысловым животным; по минеральным водам; по белому углю; по платине; по редким металлам; по стройматериалам и т. д.
Таким образом, при большевиках функции КЕПС были существенно расширены и завершена уникальная работа по изданию шеститомного фундаментального научного сборника «Естественные производительные силы России», в который вошли «Артезианские воды» (19173;1919), «Полезные ископаемые» (1917&;1919), «Растительный мир» (1917;1923), «Животный мир» (1919), «Ветер как двигательная сила» (1919) и «Белый уголь» (1921;1923). Более того, несмотря на тяжелейшие условия Гражданской войны, в 1918;1920 гг. КЕПС продолжила организацию научных экспедиций, в том числе по комплексному изучению Курской магнитной аномалии, Хибинского месторождения апатитов и всего Кольского полуострова.
В декабре 1918 г. В.И. Вернадский представил на общем собрании КЕПС обобщенный программный доклад о создании сети научно-исследовательских институтов как государственных учреждений.
А уже в 1919;1920-х гг. по решению СНК РСФСР были созданы 50 научно-исследовательских институтов, в том числе Центральный аэрогидродинамический институт (ЦАГИ), Государственный гидрологический институт, Государственный физико-технический институт, Институт изучения мозга и психической деятельности, Рентгенологический и радиологический институт, Институт по изучению Севера и другие.
Главным императивом всей деятельности КЕПС стало ее активное участие в работе Государственной комиссии по электрификации России, которая с февраля 1920 г. занималась разработкой грандиозного плана электрификации России (ГОЭЛРО), в основу которого были положены фундаментальные исследования, проводившиеся Отделом энергетики КЕПС с октября 1916 г. Более 200 крупнейших ученых и инженеров страны под руководством будущего главы Госплана СССР Глеба Максимилиановича Кржижановского в кратчайшие сроки разработали перспективный план строительства в течение ближайших десяти-пятнадцати лет 30 электростанций, в том числе Штеровской, Каширской, Нижегородской, Шатурской и Челябинской ТЭС и Нижегородской, Свирской, Волховской и Днепровской ГЭС, а также комплексного развития всей транспортной системы страны за счет магистрализации старых и строительства новых железнодорожных линий, сооружения Волго-Донского канала и т. д.
В декабре 1920 г. VIII Всероссийский съезд Советов одобрил, а в декабре 1921 г. IX Всероссийский съезд Советов утвердил план ГОЭРЛО, который, будучи грандиозным планом комплексного развития всей советской экономики, сыграл исключительно важную роль в так называемой «второй индустриализации страны» и строительства не только трех десятков электростанций, но и сотен металлургических и машиностроительных предприятий, угольных шахт, рудных разрезов и других промышленных объектов.
Не случайно именно тогда В.И. Ленин прямо заявил, что «коммунизм — это есть советская власть плюс электрификация всей страны».
В тяжелейших условиях Гражданской войны вопросы управления наукой были прерогативой не только РАН и ГОЭЛРО, но и двух важнейших государственных структур — ВСНХ и Наркомпроса РСФСР.
В августе 1918 г. при ВСНХ РСФСР был создан Научно-технический отдел (НТО), главной задачей которого стало привлечение к социалистическому строительству сотрудников лабораторий, научных и технических обществ, опытных станций и т. д. Тогда же в составе НТО создано Бюро иностранной техники, главной функцией которого стало изучение новейших научно-технических открытий зарубежных ученых и их скорейшего внедрения в разные отрасли советской экономики.
Причем, если ВСНХ РСФСР гораздо чаще ориентировался на чисто прикладные аспекты научный открытий, то Наркомпрос РСФСР курировал значительно более широкий круг вопросов организации науки.
Поэтому уже в феврале 1921 г. в его структуре был создан специальный Академический центр, куда вошел и Государственный ученый совет (ГУС) с тремя подсекциями: научно-политической, научно-технической и научно-педагогической.
После окончания Гражданской войны и перехода к мирному строительству резко поднялась значимость подлинной науки, особенно прикладных исследований, без которых грандиозные планы большевиков по социалистической модернизации страны остались бы просто на бумаге.
Поэтому в первую очередь высшее политическое руководство страны предприняло целый ряд неотлагательных мер, обеспечивающих элементарную выживаемость и спасение ученых от голодной смерти.
С конца 1920 г. в стране стала действовать особая форма их обеспечения — натуральный академический паек, который выдавался до конца 1923 г. В 1921 г. были приняты декреты «Об улучшении быта ученых» и «О мерах к улучшению жилищных условий научных работников», а при Совнаркоме РСФСР создана Центральная комиссия по улучшению быта ученых.
Тогда же в 1921 г. был издан специальный декрет «О создании благоприятных условий для работы академику И.П. Павлову», единственному на то время российскому лауреату Нобелевской премии, присужденной ему в 1904 г.
Ведущими научными центрами страны была не только Российская Академия наук, но и многие университеты и специальные высшие учебные заведения страны, удачно сочетавшие в себе преподавание фундаментальных наук с активной научно-исследовательской деятельностью.
Кроме того, научные подразделения действовали также при различных наркоматах и других государственных ведомствах страны. К началу 1921 г. только в РСФСР насчитывалось свыше 80 научно-исследовательских институтов (НИИ), не считая уже давно существующих научных лабораторий при вузах. Порядка 20 НИИ в области физики, химии, биологии и общественных наук работали при Наркомате просвещения, около 30 НИИ различного профиля существовали при ВСНХ, 40 НИИ обслуживали Наркомат здравоохранения и 4 НИИ и десятки опытных станций были при Наркомате земледелия.