Положение Короля, как было со многими Монархами в истории, после этой войны стало значительно хуже.
Желая примириться с радикалами, Государь амнистировал их вождей и разными обещаниями сумел привлечь на свою сторону самого талантливого из них, Тодоровича, но власти им Монарх не дал, и его управление и далее сохраняло прежний самодержавный характер.
В то же время сторонники его свержения воспользовались раздорами Монарха с венценосной супругой (принявшей после развода 12 (25) октября 1888 года в конце жизни католичество), до тех пор, по возможности, сохранявшимися в тайне, что вызвало крупный скандал, и было раздуто прессой как внутри страны, так и за ее пределами.
В 1888 году Король Милан изгнал Августейшую супругу из Сербии, под предлогом необходимости воспитания наследника и Цесаревича Александра (1876-1903) за границей, и потребовал от нее обязательства не возвращаться в Сербию до совершеннолетия Августейшего сына. Когда Королева Наталия отказалась от этого, Государь насильственно отобрал единственного державного сына и, к сожалению, начал громкий, но справедливый процесс о разводе.
После такого непопулярного в любой стране шага, чтобы как-нибудь улучшить свое положение, Король обнародовал новую конституцию.
Тем не менее, 22 февраля (7 марта) 1889 года Король Милан I Обренович вынужден был отречься от престола в пользу своего Августейшего сына, малолетнего Царевича Александра, регентами к которому назначил Ристича, Протича и Белимарковича.
Жизнь в изгнании
С этого времени Монарх жил по большей части в Париже под именем гГрафа Такова, но по временам наезжал в Белград, открыто руководя Августейшим сыном и регентством.
В 1891 году экс-король неожиданно опубликовал в газетах письмо, в котором доказывал, что Елена Маркович и Елена Кничанин были удавлены в тюрьме по приказанию Гарашанина. Последний отвечал, что дать такое приказание мог только сам Король, ибо Гарашанин, бывший тогда Министром внутренних дел, как раз в это время был в отпуске, и тюремные власти непосредственно подчинялись Королю. Против этих данных были представлены кое-какие возражения, факт остался не вполне выясненным, но, во всяком случае, враги Монарха сумели бросить на него тень еще раз.
Эта полемика в прессе не помешала экс-королю Милану I примириться с Гарашаниным, когда ему в 1894 году понадобилась опора. В том же году бывший Монарх примирился и с Перой Тодоровичем, изобразившим его в мрачных красках в историческом романе "Долой с престола", напечатанном в "Мале Новине" в 1892 - 1893 гг.
После 1889 года экс-король Милан I получал от своего Августейшего сына ежегодное содержание в размере 300.000 франков. В том же, 1889 году Королева Наталия, раньше изгнанная из Сербии, вернулась на родину.
В 1891 году экс-король Милан I согласился выехать из Сербии навсегда за определенную субсидию, обещанную ему Регентством, и под условием, что Королева Наталия будет тоже удалена.
Скупщина выразила Монарху благодарность за отъезд из страны и постановила просить королеву Наталию, чтобы она последовала его примеру. Король Александр к просьбе Скупщины присоединился, но Королева Наталия не пожелала исполнить ее. Тогда министерство Пашича насильно выслало ее за границу. Сторонники Королевы противились этой мере и довели дело до уличного столкновения.
В 1892 году, дабы избежать гражданской войны, экс-король Милан I принес, по его собственному выражению, новую жертву Сербскому народу и за новую субсидию в 1 миллион франков отказался от прав сербского подданства и даже от родительских прав на единственного Августейшего сына.
Несмотря на это, экс-король продолжал участвовать в сербских политических делах. Два государственных переворота в 1893-м и 1894 годах устроены были Королем Александром I Обреновичем как будто по указаниям Августейшего родителя, равно как и последующие перемены в составе Министерств.
В 1893 году 39-летний Милан I примирился с венценосной женой, и в следующем году Синод признал расторжение их брака недействительным.
Тотчас, в 1894 году экс-король, вопреки принятым обязательствам, вернулся в Сербию и с тех пор приезжал в Сербию беспрепятственно, по своему желанию, хотя предпочитал для своей безопасности и мира в стране жить в Париже или Вене, и время от времени получал новые субсидии от правительства.
В январе 1898 года Августейший сын его Король (1889-1903) Александр I Обренович назначил державного родителя своего главнокомандующим Сербской Королевской армией, что вызвало сильное недовольство в Сербии и изумление за границей.