К началу XX века ситуация в Курской губернии сильно меняется. Со стороны епархиального управления ведется усиленная противосектантская политика. Создается Знаменское миссионерское просветительское братство при Знаменском монастыре, для мирян и духовенства организовываются миссионерские курсы, в епархии учреждается должность разъездного миссионера, проводятся открытые диспуты с сектантами. Целью миссионерских братств являлось: во-первых, возбуждение в прихожанах ревности к православной вере; во-вторых, ознакомление членов братства (общества) с истинами православия; и, в-третьих, изучение сектантских лжеучений, с целью обнаружения в них искажения Божественного Откровения. Миссионерские общества организовывались из грамотных, преданных Церкви и всеми уважаемых мирян, при чем велся строгий отбор членов со стороны духовенства, чтобы не дискредитировать все дело просвещения. Под руководством священнослужителя члены общества несколько раз в неделю устраивали собрания, на которых изучали Священное Писание, читали противосектантские листки, брошюры, книги, ознакомлялись с сектантским вероучением, всесторонне обсуждали его, уясняли в своем сознании истины христианской веры, учась, таким образом, вести беседы с сектантами 15. Противосектантские епархиальные миссии финансировались не только епархиальной казной, но и тарелочными и кружечными сборами со всех храмов епархии. Так, например, все тарелочные сборы в 1-ю неделю Великого поста в Курской епархии направлялись в пользу Православного Миссионерского Общества и местного Миссионерского просветительского братства 16. Это позволяло епархии не только содержать епархиального миссионера, но и закупать, издавать и распространять различную противосектантскую литературу.
Деятельность противосектантской епархиальной миссии проходила под личным архипастырским наблюдением и руководством Высокопреосвященнейшего Питирима (Окнова), епископа Курского и Обоянского (с 1909 г. архиепископ). В оживлении миссионерской деятельности принимали также активное участие викарные епископы Белгородский Иоанникий (Ефремов) и Рыльский Иоасаф (Романов). Вся же специально миссионерская деятельность в Курской епархии лежала на обязанности одного епархиального противосектантского миссионера. Окружных и уездных миссионеров и других специальных помощников миссионера в то время не было.
Одним из поводов к возникновению миссионерских и противосектантских братств послужил царский манифест о веротерпимости, принятый 17 апреля 1905 года, который легализировал действие сект на территории Российского государства. После Высочайшего манифеста, сектанты более злобно стали относиться к православному духовенству: чувствуя себя свободными, они везде старались всячески чернить Православную Церковь, сочиняя всевозможные сплетни и клеветы на духовенство, пропагандируя открыто на площадях, вокзалах железных дорог и в вагонах, словесно и при помощи маленьких брошюр, и листков сектантской литературы.
Помимо мистического сектантства в Курской губернии сильно распространилось сектантство рационалистическое. Стали появляться общины адвентистов седьмого дня, штундотолстовцев, русских баптистов, евангельских христиан. Разрастаясь в среде бедного крестьянского населения, секты принимали все более опасный характер по отношению к Православной Церкви. В мерах "воздействия к укреплению православных чад святой Церкви от соблазна пропаганды сектантской" мы читаем: "... 2) В каждом зараженном сектантством приходе, приходский священник по возможности скорей должен устроить миссионерский приходской кружок ревнителей православия с непременным участием всех членов притча, в который допускаются учителя и учительницы церковно-приходских школ, а также и любители миссионерского дела миряне... 5) В заражённых сектантством приходах по возможности скорее бы учреждены были и открыты народные библиотеки (читальни) под надзором приходского священника, а подбор книг в такие библиотеки-читальни допускался бы только с одобрения особой комиссии Совета Миссионерско-Просветительного Братства... 10) Желательно, чтобы на большом Курском вокзале находился: постоянный разъездной книгоноша-миссионер, который мог бы с большой пользой для дела вести конкуренцию и борьбу полемики против библейского книгоноши сектанта Матвеенки" 17.
Курскому епархиальному противосектантскому миссионеру, которым в 1909 году был священник Василий Ильин, вменялось в обязанность проведение публичных и частных бесед противосектантского полемического характера, выступать с проповедями на богослужениях, организовывать и руководить собраниями пастырско-миссионерских кружков, рассылать по епархии духовенству миссионерские книги и различные пособия и т. п.
В "Отчете о состоянии сектантства и деятельности противосектантской епархиальной миссии по Курской епархии" за 1908-1909 гг. мы видим итоги деятельности курской противосектантской миссии за данный промежуток времени: "присоединено к Православной Церкви сектантов - по Белгородскому уезду: в селе Старом Городище один баптист, в селе Муроме три скопца; по Грайворонскому уезду - в селе Знаменском один баптист; по Дмитриевского уезду: в селе Седине один баптист, в селе Печенном один штундотолстовец; по Льговскому уезду: в селе Износковом один баптист; по Ново-Осколъскому уезду: в селе Тростянце один скопец; по Рыльскому уезду: в селе Кульбаках 2 штундотолстовца; в селе Кореневом 1 штундотолстовец; по Обоянскому уезду: в селе Бобрышевом 3 баптиста, в селе Медвенка 2 баптиста, в селе Ярыгино 1 скопец; по Пугивльскому уезду: в селе Казацком 2 баптиста, в Поповой слободе 1 баптист; по Староосколъскому уезду: в селе Лебедях 1 баптист; по Тимскому уезду: в селе Черновцах 5 скопцов; по Фатежскому уезду: в селе Хмелевом 2 хлыстовки; а всего 13 баптистов, 4 штундотолстовца, 12 скопцов и хлыстов, итого 29 человек 18".
Всего вКурской губернии в 1909 году рационалистического сектантства (штундобаптистов, адвентистов и штундотолстовцев) в 80 пунктах епархии имелось 1596 человек, а мистического (хлыстов и скопцов) в 48 пунктах 520 человек.
Скажем немного о возникновении в Курской губернии сект штундотолстовцев и баптистов.
Штундотолстовство появилось в Курской епархии приблизительно с 1900 года, занесенное рабочими-мастеровыми из Херсонской губернии. Эта секта является ответвлением от младоштундизма (другое название штундопашковцы или евангельские христиане, т.е. штундисты, не принявшие Гамбургского изложения веры 1849 года), который слился с учением графа Л. Н. Толстого, вследствие чего стал совершенно равнодушен к религиозным вопросам, предпочитая им политику и переустройство русской государственной жизни 20. К 1909 году штундотолстовцы появляются во многих местах епархии: в городе Курске, в селах Кореневом, Кульбаках Рыльского уезда, в городе Белгороде - в привокзальной части города. Особенно распространились они в Дмитриевском уезде в селах: Седине, Веть, Почепном, Сильном, Гламаздине, Прилепах и других. Точное число сектантов определить в то время было очень трудно, так как они не имели никакой организованной общины.
Баптизм (русский баптизм, штундобаптизм) на территорию Курской губернии начал проникать с начала XX века. В это время в близи железнодорожных станций Ржава и Солнцево организовываются первые баптистские церкви. В 1910 году образовывается община в Курске. В это время в Курск переехал из г. Баку Цимбал Фёдор Евдокимович с семьёй в 12 человек (10 детей и двое родителей), а так же вернулся с русско-японской войны курянин Иван Максимович Караулов, где он принял баптистское крещение. В их домах и стали собираться курские баптисты. Проповедь сектантов приносила свои плоды, и в 1913 году их община насчитывала 14 членов, а постоянно посещали собрания около 30 человек. Так как до 1917 года в курской общине не было рукоположенных пресвитеров, то пастырское попечение церкви в то время оказывали Митрофан Егорович Чернов, пресвитер церкви станция Ржава, старший пресвитер (епископ) по региону и Григорий Иванович Беляев, пресвитер церкви поселка Солнцево. Беляев работал машинистом на паровой мельнице станции Солнцево, а так же был председателем Курского губернского правления баптистов. В 1914 году в Курск из Харькова был сослан баптист Аркадий Георгиевич Алехин. Недовольство властей вызвало то, что он, будучи юристом, активно защищал членов Харьковской баптистской общины от преследований со стороны правительства и православного духовенства.
Находясь под влиянием проповеди баптистов, множество людей отходили от учения Православной Церкви. Для перехода в баптизм им необходимо было подать об этом прошение губернатору, об исключении из Православия и донесение в Курскую Духовную Консисторию. Консистория же, в свою очередь, приписывала благочинным сделать соответствующие пометки об этом в метрических книгах. Вот каково было содержание одного из таких документов, датируемого 29 ноября 1916 года:
"Указ Его Императорского Величества
Самодержца Всероссийского,
Из Курской Духовной Консистории.
Благочинному 1 округа Щигровского уезда
священнику Иоанну Васильеву.
По указу Его Императорского Величества Курская Духовная Консистория предписывает Вам сделать отметку в метрических книгах Спасской церкви, с. Вышней Озерны (Озерки -? - прим. свящ. В. С.) Щигровского уезда за 1876 год о переходе Ивана Алексеевича Колибаева из православия в секту евангельских христиан баптистов, и о последующем донести Консистории" 21.
Благочинные и приходские священники обязаны были подавать рапорты в консисторию о лицах, переходящих из Православия в секту или раскол. С каждым годом эти рапорты все более увеличивались. Были случаи, когда жители Курской губернии, уезжая на постоянное жительство в другую губернию, лишь перед переездом объявляли о своем намерении принять другую веру, боясь, наверное, преследования и недовольства со стороны властей. Так, например, священник Феодор Пузанов, служащий в с. Гущино Тимского округа докладывает о переходе в Таганрогскую общину евангельских христиан крестьян с. Гущино Ильи Максимовича Титяева вместе с женой Анной Филипповной и дочерью Иулианиею, а так же жительницы с. Никольского Федосеевы Дарьи Григорьевной 22.
В начале 1917 года в Курской баптистской общине произошло важное событие. Известным служителем Союза русских баптистов Федором Прокофьевичем Балихиным был рукоположен первый пресвитер Курской церкви Евангельских христиан-баптистов И. М. Караулов. Об этом событии сообщил союзный журнал "Слово истины" № 8, 1917. В это время община курских баптистов собиралась по квартирам. Их было человек 25 - 30, но всякая квартира была мала для молитвенных собраний. Из числа баптистов много было военных. Преимущественно военные и посещали богослужебные собрания. Руководили богослужениями благовестники Цимбал Федор Евдокимович и Караулов Иван Максимович, которые совершали почти такое же служение как и пресвитеры, кроме рукоположения. В этом же году с русско-турецкого фронта прибыл на лечение в Курск молодой баптист Григорий Нерубенко, военный фельдшер. Двадцатилетний юноша начал активно проповедовать Евангелие. Он стал инициатором общественного духовно-просветительского служения в Курске. Ему предложили рукоположение в пресвитеры, но он отказался от этого.
Из жителей г. Курска собрания по квартирам посещали следующие люди, которые являлись членами баптистского братства:
1. Матвеенков Тит Кондратьевич - проповедник, шеф повар ресторана на вокзале.
2. Горбачёв - носильщик на вокзале, вместе с женой и двумя дочерьми.
3. Пелих - слесарь депо Московско-Курской железной дороги
4. Сердюк Мария Игнатьевна - жена машиниста
5. Тоболин Макарий Викторович - башмачник
6. Жена Тоболина Макария Викторовича
7. Семья брата Баратаева - железнодорожника, беженцы из г. Ковеля Юго-Западной железной дороги Волынской области..
8. Цимбал Фёдор Евдокимович - проповедник, служил в управлении Московско - Киевско - Воронежской железной дороги делопроизводителем в службе тяги паровозного хозяйства.
9. Жена Цимбал Ф. Е.
10. Караулов Иван Максимович - проповедник, имел небольшую торговую лавку.
11. Нерубенко Григорий Семёнович - проповедник, военный фельдшер.
Вскоре, с согласия отдела народного образования служения начали проводиться в Вышеначальном училище по ул. Московская, д.50. (Ныне ул. Ленина, но дома не существует). Через какое-то время баптисты стали собирались в церковно-приходской школе, при Георгиевской церкви напротив Георгиевской аптеки, на Херсонской улице (ныне ул. Дзержинского). Собрания эти проводились вплоть до 1925 года и вызывали большой резонанс в обществе. Этот резонанс вызывали не только баптисты, но и почти все секты, так как для бывшей Царской России была необычна такая открытая проповедь сектантов и их популярность среди простого народа. Но вскоре этому суждено было прекратиться.