После принятия Уложения 1649 года и полного закрепощения крестьян приток беглых на Дон резко возрос. Беглец, пришедший на Дон становился казаком, но он, в отличие от «старых», «домовитых» казаков, не имел имущества и оружия и назывался «голутвенным» казаком. Оружие было необходимо для выживания и для обороны, и для разбойничьих походов.
«Старые», «домовитые» казаки тайно снабжали голытьбу всем необходимым для осуществления разбойничьих экспедиций за определенную долю добычи.
Голытьба, после того как турки в 1660 году практически закрыли казакам путь в Азовское и Черное моря, устремила свои взоры на Волгу, где грабила царские и купеческие караваны и богатые рыбные промыслы. Московские власти требовали от войска Донского усиления борьбы с казаками-разбойниками. Казачья старшина не проявляла особой настойчивости в борьбе с казачьими разбоями, т.к. зачастую донские старшины и домовитые казаки тайно участвовали в этих экспедициях на правах организаторов и финансистов. Казаки были убеждены в своем праве на грабеж неказачьего населения.
Еше одним острым вопросом во взаимоотношениях между московским правительством и казаками была проблема приема на Дону беглых, что мешало проведению в жизнь крепостнических норм Соборного уложения. В 1666 г. Москва впервые потребовала выдачи с Дона беглых крестьян. Однако войско Донское твердо придерживалось принципа невыдачи людей с Дона и считало его одной из основ казачьей самостоятельности. Само существование казачьего этноса напрямую зависело от притока на Дон смелых и энергичных люлей, преодолевших все барьеры на своем пути. Людей, способных променять сытую и скучную жизнь крепостного на полную опасностей жизнь казака, променять рало на саблю.
В 1667 году отряд голытьбы во главе со Степаном Разиным отправился в разбойничий поход.
Сам Разин происходил из домовитых, потомственных казаков по отцу и по матери. Он родился на Дону около 1630 года, и к 1667 году был известным казаком. Он участвовал во многих казачьих экспедициях, выполнял важные поручения дипломатического толка.Первоначально его отряд попытался прорваться в Азовское море, но это ему не удалось. Тогда С. Разин увел свой отряд на Волгу. На Волге разинцы занимались самым настоящим разбоем. Они грабили купеческие караваны. Спустившись вниз по Волге, Разин не встретил серьезного сопротивления. Он перезимовал и весной 1668 года напал на владения иранского шаха в Закавказье и на южном берегу Каспийского моря. В иранском фольклоре С. Разин остался как страшный беспощадный разбойник. Он разграбил Дербент, Решт и другие города, разгромил флотилию иранского шаха и летом 1669 года с огромной добычей вернулся в Россию.Царское правительство амнистировало разинцев, и они беспрепятственно смогли вернуться на Дон. Московские власти понимали, что уничтожение такого сильного отряда разбойников потребовало бы огромных сил, тем более что разинцы доказали свою боеспособность в Иране. Поэтому для российского государства пропуск разинцев на Дон был самым выгодным решением. Москва предполагала, что награбленная разиниами добыча успокоит донскую голытьбу и снимет социальную напряженность на Дону.Однако события на Дону развивались по другому сценарию. К Разину стала стекаться вся донская голытьба, увидев в нем вождя, способного привести к победам в новых походах «за зипунами». Персидскую добычу разинцы очень быстро прогуляли. Необходимо было вести армию, которая возникла вокруг Разина в новый поход. Объектом похода стала Россия. В Черкасске на Войсковом кругу Разин убил царского посла. Тем самым он объявил войну Московской Руси. Весной 1670 года Разин во главе армии в 7 тысяч человек выступил на Волгу. Он захватил Царицын и Астрахань, Саратов и Самару, но в октябре 1670 года потерпел поражение под Симбирском и вернулся на Дон в Кагальницкий городок. Разин надеялся собрать новую армию для продолжения войны. Низовые казаки опасались, что разинская авантюра приведет к карательной экспедиции московских властей. Между разницами и домовитыми казаками началась гражданская война, окончившаяся пленением Разина. Впервые казак был выдан Москве. 6 июня С. Разин был четвертован в Москве.
После поражения С. Разина царское правительство потребовало от казаков принесения присяги верности. В 1671 году казаки на Войсковом кругу приняли решение о присяге московским царям. С этого времени Дон стал вассальным по отношении к России государством. По условиям присяги казаки обязывались выдавать государственных преступников Москве, тем самым нарушался важнейший принцип существования Дона, — право убежища.Разинское движение показало московским властям действительную силу нового этноса. Казачий этнос угрожает самим основам Московской Руси. Любой новый этнос стремится к расширению своего влияния, своих территориальных границ, что ясно показало разинское движение. Однако казачий этнос строил свое существование в основном не на использовании ресурсов породившего его ландшафта, а на грабеже других народов. Такой путь не имел перспективы.На рубеже XVII—XVIII веков породившие казаков великороссы переживали период грандиозной трансформации, связанный с деятельностью Петра Великого. Изменение великороссов вызвали серьезные перемены в образе жизни казачьего этноса. Грабеж окружающих народов как основная форма хозяйственной деятельности стал невозможен в силу политики империи великороссов. Пополнение этноса за счет великороссов стало невозможнр по той же причине. Однако казаки не погибли. Они сумели вписаться в окружающий их ландшафт, превратившись из воинов-разбойников в воинов-тружеников. Этот процесс был противоречивым. Он сопровождался подчинением независимой донской республики российской империи. Казаки сопротивлялись, воевали с войсками империи. В итоге империя победила. Казаки вошли в состав российской империи на правах ограниченного, однако автономного образования. Казаки сохранили свою самобытность. Более того, в российской империи казаки получили особые права и обязанности. Быть казаком в России стало почетно. Если раньше казак был синонимом слова разбойник, бунтарь, то в российской империи казак стал синонимом оплота многонациональной российской империи.
Подчинение Дона Москве началось с азовских походов Петра Великого.