Налоговый кодекс обязывает налогоплательщика вести раздельный учет операций облагаемых и не облагаемых НДС (пункт 4 статьи 149 НК РФ). Аналогичное требование содержится в пункте 2 статьи 5 Закона РФ от 06.12.91 № 1992-1 «О налоге на добавленную стоимость». Право на получение налоговой льготы Налоговый кодекс (пункт 6 статьи 149) ставит в зависимость от наличия у налогоплательщика лицензии на осуществление соответствующего вида деятельности, если последняя лицензируется в соответствии с законодательством. Закон РФ от 06.12.91 № 1992-1 «О налоге на добавленную стоимость», начиная с его редакции, введенной Федеральным законом от 02.01.2000 № 36-ФЗ, также указывал на необходимость наличия лицензии для получения льгот по НДС.
Отказ от льготы по НДС
Налогоплательщик может отказаться от использования льгот по НДС, однако отказ принимается только в части льгот, поименованных в пункте 3 статьи 149 НК РФ. Действовавший ранее Закон РФ от 06.12.91 № 1992-1 «О налоге на добавленную стоимость» также предусматривал возможность отказа от применения льгот, предоставляющихся в соответствии с подпунктами "ф", "х" и "ю" пункта 1 статьи 5 указанного закона. Однако в отличие от Закона РФ от 06.12.91 № 1992-1 «О налоге на добавленную стоимость», Налоговый кодекс предусматривает специальную процедуру отказа от использования налоговой льготы (пункт 5 статьи 149 НК РФ).
Для того, чтобы отказаться от льготы по НДС, налогоплательщик должен представить в налоговый орган соответствующее заявление не позднее 1 числа налогового периода, начиная с которого происходит отказ. Например, если налогоплательщик предполагает отказаться от льготы с 1 марта 2001 года, то он должен представить заявление в налоговый орган не позднее 1 марта 2001 года (поскольку налоговым периодом по НДС является календарный месяц). Если налогоплательщик отказывается от применения льготы, то такой отказ распространяется на все хозяйственные операции, приводящие к возникновению соответствующего объекта обложения. То есть, не допускается продажа товаров (работ, услуг) одним покупателям с учетом налога, а другим – без налога. Кроме этого, не допускается отказ от налоговых освобождений на срок менее одного года.
Применение отдельных льгот по НДС в 2001-2004 годах
Особенности применения отдельных льгот по налогу на добавленную стоимость в 2001-2004 годах установлены Федеральным законом от 05.08.2000 № 118-ФЗ «О введение в действие части второй Налогового кодекса Российской Федерации и внесении изменений в некоторые законодательные акты о налогах». Хотя Закон РФ от 06.12.91 № 1992-1 «О налоге на добавленную стоимость» утратил силу с момента введения в действие части второй Налогового кодекса, действие ряда налоговых льгот, установленных указанным законом, продлено на 2001 год. Соответствующие положения статьи 149 НК РФ вводятся с 1 января 2002 года (см. таблицу).
Таблица. Льготы, действующие в 2001 году в редакции Закона «О налоге на добавленную стоимость»
| Льготы по Закону «О налоге на добавленную стоимость» (на 2001 год) | Льготы по Налоговому кодексу (начиная с 2002 года) | Комментарий |
| Работы по строительству жилых домов, производимому с привлечением средств бюджетов всех уровней при условии, что такие средства составляют не менее 50 процентов от стоимости этих работ (подпункт «т» пункта 1 статьи 5 Закона) | Не предусмотрено | С 1 января 2002 года, строительные работы, проводимые с использованием бюджетных средств, будут облагаться НДС в общем порядке. |
| - Лекарственные средства, изделия медицинского назначения и медицинская техника (подпункт «у» пункта 1 статьи 5) - технические средства, включая автомототранспорт, которые не могут быть использованы иначе, как для профилактики инвалидности и реабилитации инвалидов, лекарственные средства, изделия медицинского назначения, протезно-ортопедические изделия, медицинская техника, а также сырье и комплектующие изделия для их производства (подпункт «щ» пункта 1 статьи 5 Закона) | Медицинские товары отечественного и зарубежного производства по перечню, утверждаемому Правительством Российской Федерации: - важнейшие и жизненно необходимые лекарственные средства, включая лекарства - субстанции, в том числе внутриаптечного изготовления, за исключением сырья (материалов) для их производства, витаминизированной и лечебно - профилактической продукции пищевой, мясной, молочной, рыбной и мукомольно-крупяной промышленности, бытовых дезинфицирующих, инсектицидных и дератизирующих средств, подгузников, репеллентов, товаров ветеринарного назначения, тары и упаковки; - важнейшие и жизненно необходимые изделия медицинского назначения; - важнейшая и жизненно необходимая медицинская техника; (абзацы второй, третий и четвертый подпункта 1 пункта 2 статьи 149 НК РФ) | В соответствии с Налоговым кодексом с 1 января 2002 года от налога будут освобождаться не все лекарственные средства, изделия медицинского назначения и медицинская техника, а только те их них, которые признаны в установленном порядке важнейшими и жизненно необходимыми. |
| Ввозимые на территорию Российской Федерации сырье, материалы и оборудование, закупаемые предприятиями народных художественных промыслов для производства изделий народных художественных промыслов (подпункт «щ» пункта 1 статьи 5 Закона) | Не предусмотрено | С 1 января 2002 года льгота будет отменена. |
| Технологическое оборудование (комплектующие и запасные части к нему), аналоги которого не производятся в Российской Федерации, по перечню, утверждаемому Правительством Российской Федерации. (Указанная льгота предоставляется по технологическому оборудованию, в отношении которого ранее предоставлялась льгота по налогу на добавленную стоимость, оплаченному до 1 января 1999 года.) (подпункт «щ» пункта 1 статьи 5 Закона) | Не предусмотрено | С 1 января 2002 года льгота будет отменена. |
| Обороты по реализации продукции средств массовой информации, книжной продукции, связанной с образованием, наукой и культурой, а также редакционная, издательская и полиграфическая деятельность по производству книжной продукции, связанной с образованием, наукой и культурой, газетной и журнальной продукции; услуги по транспортировке, погрузке, разгрузке, перегрузке периодических печатных изданий и книжной продукции, связанной с образованием, наукой и культурой (подпункт «э» пункта 1 статьи 5 Закона) (Льготы не распространяются на продукцию средств массовой информации рекламного и эротического характера, а также издания рекламного и эротического характера.) | - Реализация научной и учебной книжной продукции, а также редакционная, издательская и полиграфическая деятельность по ее производству и реализации; (подпункт 17 пункта 3 статьи 149 НК РФ, утрачивает силу с 1 января 2002 года) - реализация продукции средств массовой информации, книжной продукции, связанной с образованием, наукой и культурой; редакционных, издательских и полиграфических работ и услуг по производству продукции средств массовой информации и книжной продукции, связанной с образованием, наукой и культурой. (подпункт 21 пункта 3 статьи 149 НК РФ, утрачивает силу с 1 января 2002 года) (Льгота не распространяется на продукцию средств массовой информации рекламного и эротического характера, а также на книжную продукцию рекламного и эротического характера.) | Налоговый кодекс не предусматривает освобождение от налога услуг по транспортировке, погрузке, разгрузке, перегрузке периодических печатных изданий и книжной продукции, связанной с образованием, наукой и культурой. |
| Работы и услуги по реставрации и охране памятников истории и культуры, охраняемых государством (подпункт «я.1» пункта 1 статьи 5 Закона) | Ремонтно-реставрационные, консервационные и восстановительные работы, выполняемые при реставрации памятников истории и культуры, охраняемых государством, а также культовых зданий и сооружений, находящихся в пользовании религиозных организаций (за исключением археологических и земляных работ в зоне расположения памятников истории и культуры или культовых зданий и сооружений; строительных работ по воссозданию полностью утраченных памятников истории и культуры или культовых зданий и сооружений; работ по производству реставрационных, консервационных конструкций и материалов; деятельности по контролю за качеством проводимых работ) (подпункт 15 пункта 2 статьи 149 НК РФ) | В Налоговом кодексе дополнительно освобождены работы по реставрации культовых зданий и сооружений, используемых религиозными организациями, а также уточнен перечень реставрационных работ, освобождаемых от налога. |