В 1353 году были открыты здания факультетов и коллегий. Выстроены при большой финансовой поддержке императора, сразу в Праги были все великие факультеты – теология, медицина, артистический. Пражский университет сразу заполняется. Около 4 тысяч студентов – это большая цифра: половина из Богемии, а половина из других регионов.
В 1372 году первое потрясение пражского университета: взбунтовались как раз юристы. Имперские юристы были недовольны давлением магистров, взбунтовались, устроили сецессию.
Этнический вопрос: богемская, польская, баварская и саксонская. В Праге это деление отражало реальный национальный состав. История пражского университета занимает исключительное место. Сами деятели этого университета воспринимали себя как лучшую избранную часть богемского королевства. Уже в Новое время, в 20-ом веке имперские истоки университета. Когда сталкивались богемская и саксонская нация, речь шла о том, что все славяне объединялись против всех германцев. Первая ссора в 1384 году. То есть достаточно быстро. Чехи пожаловались, что ректор отдает предпочтение немцам. Начался бунт. Схватили ректора университета. Если бы в самом конце XIV века в Чехии не началось религиозно-политическое брожение.
В 1403 году Ян Гус на общеуниверситетском диспуте защищает учение. Он был уважаемым, популярным магистром. После того как победа формально была присуждена противнику Гуса – обсуждать учение Уиклифа запретили.
В 1406 году из Оксфорда прибыли двое чешских студентов и привезли оттуда документ, одобрявший учение Уиклифа (профессор Оксфордского университета). Основатель учения виклифистов, впоследствии превратившегося в народное движение лоллардов, реформатор и предшественник протестантизма.
В 1409 году власти университета решают как-то принять меры к возвращению в мирное русло. Принимается новый королевский статут, который ограничивал права германской нации в стенах пражского университета. Немцы обиделись и ушли. Они отправились на родину и осели в более северных германских княжествах. В 1402 году был основан университет в Винсбурге. В 1409 году – в Лейпциге. 1419 год – Росток. 1459 год – Базель. 1459 год – Ингольштат, 1476 год – Цундерген. Немецкие университеты были ориентированы на запросы локальных княжеств, они были небольшими. Расширение числа университетов вовлекало все большое количество знати в этот процесс. Грамотных клириков стало больше. В 1408 году пражский университет пережил еще один удар – связано это было со схизмой. В 1409 году на соборе в Пизе был избран папа Александр V. Он издает буллу об учреждении эутифизма в Праге этого не ожидали. Гус был сторонником эутифизма. В Чехии заговорили нужна ли вообще эта папская власть. В 1414-1418 гг. идет вселенский собор в Костанце. Один из соборов который помог восстановить
Реформация во многом является движением университетским.
Лютер начинает свой путь как нищенствующий монах Августинов.
Богословское образование он получает в Виттенберге. Первое правление реформаторов были носителями образованности. Внимание к тексту Библии проистекало из метода чтения. Реакция власти: князья университетских деятелей одобряли и поддерживали. Университеты Германии стали поддержкой для княжеской власти и способствовали внутренним войнам. Конфессионализация в Германии развивалась сложно. Кальвинисткие теологи начинаются изучать библейскую историю и археологию. К натурфилософии относились критически. Изучение как этот библейский текст сделан. В университетах было необходимо ввести такие дисциплины как изучение языка – греческий(его знали тогда весьма плохо) + древнееврейский. Благодаря кальвинистам это входит в университетский – курикулум vitae – «комплекс наук в университетской жизни». Благодаря кальвинистам был основан университет в Европе (Голландия) – в Лейдене в 1575 году. На тот момент статхаудером Вильгельмом Оранским. В Лейдене была огромная группа французов – гугеноты. Гуго Гроций Ориентировался не на богословие, а на право. Правовые учения этого периода своим главным предметом сделали разработку естественного права. Такое новое направление в проведении оформилось в школу естественного права, которая доминировала в юриспруденции на протяжении 17-18 столетий. Родоначальником ее был голландский юрист Гуго Гроций (16-17 век). Человек обладает определенным набором прав и свобод, которые неотчуждаемые.
Жозеф Скалигер (Лейден) принимал участие в религиозной войне своего времени: как учёный-филолог он разоблачал подложность ряда папских документов, как солдат — сражался в рядах гугенотов. Липсий Юст (Лёвенский университет).