ВВЕДЕНИЕ
токсоплазма отличается от почти всех других членов большой семьи кокцидий (Филюм Apicomplexa) из-за исключительного диапазона животных (практически все теплокровные животные), которые служат в качестве хозяина для его промежуточного жизненного цикла. Как и в других кокцидий, токсоплазмы завершает окончательный жизненный цикл в одном животного-хозяина (Dubey и соавт., 1970); Однако, способность ооцист (пролил от кошачьего хоста), а также кист ткани производится в промежуточных хозяев, чтобы заразить любого типа хоста (Dubey и Битти, 1988) позволило Toxoplasma увеличить диапазон хоста (Су и др., 2003), Половые этапы кошачего хозяин приводит к развитию ооциста, которые пролили в окружающую среду (Long, 1982), где загрязнение почвы или воды привело к эпидемии человека
токсоплазмоз (Бродячий-Педерсен и Лорентцен-Стыр, 1980; Конисуйте и Takahashi, 1987; Bowie и др, 1997;. Choi и др, 1997;. Isaac-Рентон и др., 1998). Кроме того, ооцисты являются основным источником Toxoplasma инфекций скота, предназначенных для убоя и потребления человека (Andrews и др, 1997;. Матеуш-Пинилья и др., 1999).
Учитывая важность Toxoplasma инфекций человека населения, понимание разработки-психических механизмов, инициируемых спорозоитов или bradyzoites, приводящих к образованию ткани цист будет занимать центральное место в конечном счете, контроль передачи и хронические заболевания. Исследования первичных инфекций Toxoplasma у животных и в sporozoite- и брадизоитных-инфицированные культур в пробирке (Dubey и Френкель, 1976; Dubey, 1998, Джером и др., 1998;. Радка и др, 2003) показывает, что развитие INITI-ованный по либо спорозоитов или брадизоитный этап
Токсоплазма. Модельные Apicomplexan-перспективы и методы, под редакцией Weiss & Kim
ISBN-13: 978-0-12-369542-0
ISBN-10: 0-12-369542-2
Copyright © 2007 Elsevier Ltd.
Все права воспроизведения в любой форме зарезервированы.
420 GENE РЕГУЛИРОВАНИЕ
аналогично, и, вероятно, является следствием единой генетической программы (Радке и др., 2003). Таким образом, defin-ки изменения в экспрессии генов, которые Accom-пание этого путь развития будет иметь важное значение для понимания основных механизмов, ответственных за токсоплазмоз, вызванным либо путями инфекции. В следующих четырех разделах обзора текущего понимания транскриптома Toxoplasma (раздел 16.2), как она изменяется в течение паразита промежуточного жизненного цикла. Эти исследования показывают, что мРНК пулы являются динамическими, и указывают, что транскрипционный контроль является основным средством регулирования переходов развития в паразита. Именно в этом контексте мы также обсудим доказательство того, что Toxoplasma обладает таким же репертуаром механизмов регулирования Tran-scription как это наблюдается в других хорошо изученном эукариоте, от дрожжей до многоклеточных животных (разделы 16.3 и 16.4). Раздел 16.5 кратко рассматриваются замечания, которые указывают, что пост-транскрипционной регуляции также могут быть активными в этом паразита.
Транскриптома
Токсоплазменных
В настоящее время ресурсы генома
Ранние попытки ускорить обнаружение генов в Toxoplasma привело к последовательности для> 120 000 ЭЧТ из Rh- и ME49 штамма-тахизоитов, а также ME49 штамма-bradyzoites и Вег ооцист деформации (Ajioka и др., 1998;. Manger и соавт, 1998; Li и др, 2003;.. Л. Ли и др, 2004). Сайт ApiDots (https://www.cbil.upenn.edu/apidots/) предоставляет доступ к этим данным и из других apicomplexan паразитов клинического и ветеринарного интереса, в том числе Eimeria tenella, Neospora сатпит, малярийный плазмодий и Sarcocystis neurona. EST-последовательности были собраны, чтобы генерировать консенсусные последовательности, а затем прокомментированы сходства с известными последовательностями нуклеиновых кислот и белков (Li и др., 2003). Этот набор данных имеет Facili-рован идентификацию и характеристику отдельных генов и помогли определить промежуточные этапы жизненного цикла паразита (Л.
На момент написания проект Toxoplasma SAGE и 10X-весь проект генома для типа II-Me49B7 штамма были завершены. BAC клон конца последовательность (https://www.sanger.ac.uk/Projects/ T_gondii) и 10X дробовик геномные секвенирований проекты (https://www.tigr.org/tdb/e2k1/tga1/) сходились, и ToxoDB (https://ToxoDB.org) репозиторий, содержащий эти данные предоставляет ресурс генома для токсоплазмов (Киссинджер и др., 2003). Эта база данных предлагает растущий массив данных горных инструментов для анализа проекта последовательности. Далее последовательность генома, чтобы обеспечить охват 5X типа с I и штамм типа III, в настоящее время ведется, и весь геном микрочип на основе типа II, эталонные штаммы-Me49B7 также находятся в разработке. Особенности проекта генома описаны и в обобщенном виде в текущей главе. К тому же,