Второй широкий класс комплексов хроматина у эукариот состоит из SWI2 / SNF2 ДНК-зависимой АТФазы, которые играют роль в репрессии транскрипции, а также Acti-vation (Mohrmann и Verrijzer, 2005). Хотя механизм действия этих факторов является Инком-стью понимать, что, как полагают, энергия гидролиза АТФ используется, чтобы изменить или переместить нуклеосомы (Джонсон и др., 2005). Все члены семейства SWI2 / SNF2 содержат характерный домен АТФазы, состоящий из части N-концевого DEXDc и HELICc части С-концевая. Дальнейшая классификация на основе гомологии последовательности и
434 GENE РЕГУЛИРОВАНИЕ
дополнительные структурные особенности приводят к четырем отдельным типам: Члены SNF2 (содержит бромодомны), ISWI (содержат домен САНТА), Ми-2 (содержат chromodomain) и Ino80 / SRCAP / p400 (содержит длинную вставку между DEXDc и HELICc домены). Предыдущие отчеты описали SWI2 / SNF2 факторы в Apicomplexa, в том числе гомолога ISWI в Plasmodium и SRCAP гомолога в Toxoplasma (TgSRCAP, AAL29689), Cryptosporidium, и Plasmodium (Ji и Арнота, 1997; Sullivan и др., 2003).
Только TgSRCAP был изучен в любом подробно. Как человеческий SRCAP, TgSRCAP может функционировать для повышения CREB-опосредованной транскрипции в присутствии HAT ОШП в пробирке (Sullivan и др., 2003). Однако, белок с сходством с CBP или CR не был найден; Поэтому его роль в токсоплазмы еще предстоит выяснить. Для лучшего понимания того, что TgSRCAP может сделать, дрожжи два гибрида экран был проведен с использованием пространного «» распорной области, разделяющей области DEXDc и HELICc как «приманка» (Nallani и Sullivan, 2005). Соответствующая область в человеческом SRCAP связывает ОШП (Джонстон и др., 1999). Большинство из самых сильных взаимодействующих белков, выделенных и подтверждены в пробирке со-иммунопреципитации являются новыми паразит специфические белки, не имеющие гомологов в других эукариотов. Некоторые из них из генов, предсказанных для кодирования доменов sugges-тиве роль в процессах ДНК - в том числе Тран-scription. Особый интерес представляет первый белок описано в Toxoplasma, чтобы содержать Kelch повторы и домен ВТВ / POZ (Nallani и Sullivan, 2005). POZ домены из нескольких цинковых пальцев белков были показаны, опосредуют transcrip-ционной репрессию и взаимодействовать с компонентами гистондеацетилазы со-репрессор комплексов. Ген впоследствии был клонирован (DQ174778) и называется TgLZTR, так как он наиболее похож на человеческий лейцин-Zipper-как транскрипционный регулятор - ген удален у людей с синдромом DiGeorge (Kurahashi и др., 1995). Будущие исследования должны eluci актуальной роли TgLZTR и связывает ли он с TgSRCAP в естественных условиях. Особый интерес представляет первый белок описано в Toxoplasma, чтобы содержать Kelch повторы и домен ВТВ / POZ (Nallani и Sullivan, 2005). POZ домены из нескольких цинковых пальцев белков были показаны, опосредуют transcrip-ционной репрессию и взаимодействовать с компонентами гистондеацетилазы со-репрессор комплексов. Ген впоследствии был клонирован (DQ174778) и называется TgLZTR, так как он наиболее похож на человеческий лейцин-Zipper-как транскрипционный регулятор - ген удален у людей с синдромом DiGeorge (Kurahashi и др., 1995). Будущие исследования должны eluci актуальной роли TgLZTR и связывает ли он с TgSRCAP в естественных условиях. Особый интерес представляет первый белок описано в Toxoplasma, чтобы содержать Kelch повторы и домен ВТВ / POZ (Nallani и Sullivan, 2005). POZ домены из нескольких цинковых пальцев белков были показаны, опосредуют transcrip-ционной репрессию и взаимодействовать с компонентами гистондеацетилазы со-репрессор комплексов. Ген впоследствии был клонирован (DQ174778) и называется TgLZTR, так как он наиболее похож на человеческий лейцин-Zipper-как транскрипционный регулятор - ген удален у людей с синдромом DiGeorge (Kurahashi и др., 1995). Будущие исследования должны eluci актуальной роли TgLZTR и связывает ли он с TgSRCAP в естественных условиях. POZ домены из нескольких цинковых пальцев белков были показаны, опосредуют transcrip-ционной репрессию и взаимодействовать с компонентами гистондеацетилазы со-репрессор комплексов. Ген впоследствии был клонирован (DQ174778) и называется TgLZTR, так как он наиболее похож на человеческий лейцин-Zipper-как транскрипционный регулятор - ген удален у людей с синдромом DiGeorge (Kurahashi и др., 1995). Будущие исследования должны eluci актуальной роли TgLZTR и связывает ли он с TgSRCAP в естественных условиях. POZ домены из нескольких цинковых пальцев белков были показаны, опосредуют transcrip-ционной репрессию и взаимодействовать с компонентами гистондеацетилазы со-репрессор комплексов. Ген впоследствии был клонирован (DQ174778) и называется TgLZTR, так как он наиболее похож на человеческий лейцин-Zipper-как транскрипционный регулятор - ген удален у людей с синдромом DiGeorge (Kurahashi и др., 1995). Будущие исследования должны eluci актуальной роли TgLZTR и связывает ли он с TgSRCAP в естественных условиях.
В дополнение к TgSRCAP, геном токсоплазмы содержит, по меньшей мере, 15 возможных гомологов SWI2 / SNF2.
Ни один из предсказанных белков не имеют бромодомны, но два (TgTwinScan_2264 и 1843), имеют высокую степень сходства с членами подкласса SNF2. Один дополнительный белок содержит предсказанную домен САНТА (TgTwinScan_2326), что делает его веро тный ортолог ISWI, а другой содержит CHRO-modomain (TgTwinScan_6651), что делает его веро-состояние Ми-2 ортологом. Другая предсказанная SWI2 / SNF2 семьи АТФаза в токсоплазмах включают тот, который имеет сильную ISWI гомологии (TgTwinScan_7555), но имеет крюк домен AT вместо домена SANT, и несколько гаваней КОЛЬЦА (TgTwinScan_2150 и 5444) или пальцы PHD цинка (TgTwinScan_2820), которые являются потенциальные области взаимодействия белок-белок.