Нойдек и сотрудники использовали сравнительный анализ протеома, чтобы продемонстрировать, что уровень экспрессии GRA 7 коррелирует с вирулентностью в
БК штамм Т. гондий, хотя не известно, потеря вирулентности, является ли прямая conse-тельность приведенного выражения GRA7 (Нойдек и др., 2002). Коэн также продемонстрировал изменения в протеоме штамма S48 Т. гондий тахизоитов (Cohen, 2002). S48 тахизоиты штамм, как полагают, не образуют цисты ткани и являются основой Toxovax ™, единственной коммерческой вакцины против токсоплазмоза, используется для защиты овец от аборта (Бакстон и Innes, 1995). Nischik и сотрудники использовали сравнительный 2-DE, чтобы попытаться иден-тифами детерминантов Toxoplasma вирулентности, и отметили модуляцию ряда белков, в том числе актина, каталаза, нуклеозидтрифосфат гидролазы 1, microneme, плотной гранулы и rhoptry белков в ослабленном формы. Gastens и Фишер также использовали сравнительный анализ протеома сравнить мышь вирулентных и ослабленных токсоплазмы. Гель-к-гель анализ показал белок 53-кДа, который был заметно пониженную в ослабленных паразитов. Дальнейший анализ с помощью ESI-MS / MS обнаружены три пептиды, один из которых совпавшие последовательность Т. гондий EST в ослабленных паразитов, которые, как представляется, гомолог эукариот перевод фактора Перво-ции eIF4A. Идентификация этого белка была подтверждена с помощью иммуноблоттинга с использованием Antibod-х лет против предсказанной N-конца Т. гондия eIF4A, и дифференциального выражение между Вирой-одолжил и авирулентными паразитами подтвержденными. Подавление этого белка в ослабленных паразитов, а также в bradyzoites предполагает, что она участвует в гомеостазе синтеза белка в токсоплазмы (Gastens и Фишер, 2002). Однако белки, определенные в этих исследованиях, возможно, кажутся маловероятными кандидатами в качестве основных детерминант вирулентности, появляясь, а отражать белки, связанные с более быстрым ростом, внутриклеточной репликацией и вторжением. Остается проблема протеомики улучшить дизайн эксперимента, чтобы сосредоточиться на первичных, а не вторичных механизмах действия. Это может быть достигнуто только путем размещения большего акцента на суб-протеых исследования, которые позволяют глубже добычу протеома, и в отношении протеомики не изолированно, а в качестве одного из нескольких дополнительных инструментов для изучения функции генов в Т. гондиях.
| ПРОТЕОМИКА в качестве инструмента для рассекает иммунный ответ на инфицировании |
Протеомика представляет собой идеальный инструмент для terize-символа и фенотипический ответ паразита на событие гену нокаут, особенно в тех случаях, когда нет никаких очевидных морфологических или биологических изменений в организме. Термин «нет фенотипа» для гена нокаута эксперимента часто вводит в заблуждении-ING, как часто ошибочно относится к фенотипам, которые могут быть немедленно наблюдаемыми - такие, как потеря вирулентности. В самом деле, делеция гена и последующее выживание паразита может выявить значительный объем информации, как со сложностью его биологии и наличием альтернативных путей метаболизма. Протеомики является отличным способом, чтобы обнаружить невидимые компенсаторные биохимические ответы на ген нокаут события. Бхатти и его сотрудники использовали сравнительные 2-DE гели и идентификацию MS белков, чтобы идентифицировать генные продукты, пострадавшие от потери гистонацетилтрансферазы GCN5 в Т. гондиях (БХАТТИ и др., 2006). GCN5 является гистонацетилтрансферазой, что имеет важное значение для развития у млекопитающих и важно подчеркнуть ответы в дрожжах. Потеря GCN5 в T.gondii, дает жизнеспособные пара-сайты и не ослабляет вирулентность в естественных условиях в модели мыши, но вызывает понижающей регуляции белков, участвующих в обмене веществ и клеточной сигнализации, а также те, которые связаны с вторжением. Вместе с другими данными, эти исследования помогли управлять открытием второго GCN5 (TgGCN5-B), который имеет потенциал, чтобы компенсировать TgGCN5-А и выявить неожиданные сложности в GCN5 аппарате Toxoplasma. GCN5 является гистонацетилтрансферазой, что имеет важное значение для развития у млекопитающих и важно подчеркнуть ответы в дрожжах. Потеря GCN5 в T.gondii, дает жизнеспособные пара-сайты и не ослабляет вирулентность в естественных условиях в модели мыши, но вызывает понижающей регуляции белков, участвующих в обмене веществ и клеточной сигнализации, а также те, которые связаны с вторжением. Вместе с другими данными, эти исследования помогли управлять открытием второго GCN5 (TgGCN5-B), который имеет потенциал, чтобы компенсировать TgGCN5-А и выявить неожиданные сложности в GCN5 аппарате Toxoplasma. GCN5 является гистонацетилтрансферазой, что имеет важное значение для развития у млекопитающих и важно подчеркнуть ответы в дрожжах. Потеря GCN5 в T.gondii, дает жизнеспособные пара-сайты и не ослабляет вирулентность в естественных условиях в модели мыши, но вызывает понижающей регуляции белков, участвующих в обмене веществ и клеточной сигнализации, а также те, которые связаны с вторжением. Вместе с другими данными, эти исследования помогли управлять открытием второго GCN5 (TgGCN5-B), который имеет потенциал, чтобы компенсировать TgGCN5-А и выявить неожиданные сложности в GCN5 аппарате Toxoplasma. но вызывает понижающей регуляции белков, участвующих в обмене веществ и клеточной сигнализации, а также те, которые связаны с вторжением. Вместе с другими данными, эти исследования помогли управлять открытием второго GCN5 (TgGCN5-B), который имеет потенциал, чтобы компенсировать TgGCN5-А и выявить неожиданные сложности в GCN5 аппарате Toxoplasma. но вызывает понижающей регуляции белков, участвующих в обмене веществ и клеточной сигнализации, а также те, которые связаны с вторжением. Вместе с другими данными, эти исследования помогли управлять открытием второго GCN5 (TgGCN5-B), который имеет потенциал, чтобы компенсировать TgGCN5-А и выявить неожиданные сложности в GCN5 аппарате Toxoplasma.