КОТОРЫХ Протеое? Протеомы и суб-протеомы Т. гондий




 

Успех протеомики анализа зависит от тщательного экспериментального проектирования, из которых пробоподготовка является первой и, возможно, самым важным шагом. Если цель эксперимента является отображение полной или суб-протеом, то это Эссене-TiAl, что белки, которые в настоящее время отображенные представляют чистый, или по крайней мере сильно обогащены, гидроразрыва-ции, чтобы предотвратить дорогостоящий анализ многих белков не принадлежащий к протеому под Investiga Тиона. Хотя это может показаться очевидным, что это не тривиально, а в случае облигатных внутриклеточных паразитов, таких как Т. гондий требует успешного разделения паразитов из клеток-хозяев. Хотя существуют надежные методы для разделения тахизоитов из клеток-хозяев, выращенных в пробирке (мы обнаружили фильтрацию тахизоитов через 3-ìМ пор фильтры высокой эффективности для последующего анализа протеома) (Cohen и др., 2002), требование к отделению от тканей принимающих делает анализ в естественных условиях, полученными из цистой ткани проблемной. Даже самые лучшие методы обогащения для кист ткани с использованием градиента плотности результата centrifuga-Тион в препаратах цисты, которые содержат очень высокие пропорции ткани хозяина. Кроме того, количество мышей, необходимых для получения достаточного количества материала может быть непомерно высокой. Proteomic анализ других в естественных условиях стадии Т. гондий, такие как сексуальные стадии в кошке, являются привлекательной перспективой, но, к сожалению, в настоящее время трудно себе представить, как достаточный материал может быть получено, первая для разработки эффективного обогащения материал, и во-вторых, чтобы выполнить препаративного анализ этих этапов.


546 ПРОТЕОМИКА OF токсоплазма


 

Протеом любой клетки состоит из heteroge-ое смеси растворимых и гидрофобных белков, некоторые из которых могут присутствовать в больших количествах, стабильные в то время как другие находятся в переходных и почти не поддающихся обнаружению количествах. Очевидный способ преодолеть проблему сложности упростить смесь белков перед анализом. Это Princi-PLE привело к развитию «суб-протеомики». Суб-протеомика зависит от подготовки или обогащений меньшей части общего протеома, используемой стратегии, например, Zhou и его сотрудниками для анализа белка репертуара выделительных-секреторных продуктов Т. гондия (Zhou и др., 2005). Такой подход является весьма полезным, когда исследование ограничиваются белками конкретной органеллы, в которой был создан способ очистки органеллы (Йейтс и др., 2005). Есть, однако, несколько важных предостережений к суб-протеомики подхода. Во-первых, интерпретация полученных данных следует принять во внимание в уверенности, размещенной на способе получения и степени обогащения, полученного для органелл или суб-протеомом под investi-gation. Во-вторых, белковый состав органелл может находиться в непрерывном потоке в зависимости от биологического состояния клетки. В-третьих, многие молекулы в цитоплазме взаимодействуют с organel-лар протеомов и могут быть связаны с этими белками, хотя и не строго вытекает из самой органеллы. Таким образом, с суб-протеомики и органелл протеомики экспериментов, воспроизводимой пробоподготовки, Иммунолокализация для проверки происхождения вновь открытых белков и тщательные биоинформатики интерпретация протеомики данные являются важными дополнением к успешной учебы. несколько важных предостережений в суб-протеомики подхода. Во-первых, интерпретация полученных данных следует принять во внимание в уверенности, размещенной на способе получения и степени обогащения, полученного для органелл или суб-протеомом под investi-gation. Во-вторых, белковый состав органелл может находиться в непрерывном потоке в зависимости от биологического состояния клетки. В-третьих, многие молекулы в цитоплазме взаимодействуют с organel-лар протеомов и могут быть связаны с этими белками, хотя и не строго вытекает из самой органеллы. Таким образом, с суб-протеомики и органелл протеомики экспериментов, воспроизводимой пробоподготовки, Иммунолокализация для проверки происхождения вновь открытых белков и тщательные биоинформатики интерпретация протеомики данные являются важными дополнением к успешной учебы. несколько важных предостережений в суб-протеомики подхода. Во-первых, интерпретация полученных данных следует принять во внимание в уверенности, размещенной на способе получения и степени обогащения, полученного для органелл или суб-протеомом под investi-gation. Во-вторых, белковый состав органелл может находиться в непрерывном потоке в зависимости от биологического состояния клетки. В-третьих, многие молекулы в цитоплазме взаимодействуют с organel-лар протеомов и могут быть связаны с этими белками, хотя и не строго вытекает из самой органеллы. Таким образом, с суб-протеомики и органелл протеомики экспериментов, воспроизводимой пробоподготовки, Иммунолокализация для проверки происхождения вновь открытых белков и тщательные биоинформатики интерпретация протеомики данные являются важными дополнением к успешной учебы.

 



Поделиться:




Поиск по сайту

©2015-2024 poisk-ru.ru
Все права принадлежать их авторам. Данный сайт не претендует на авторства, а предоставляет бесплатное использование.
Дата создания страницы: 2019-06-03 Нарушение авторских прав и Нарушение персональных данных


Поиск по сайту: