Генетические подходы для определения генов вирулентности




 

Одним из главных преимуществ классической генетики является то, что она обеспечивает вперед генетический анализ сложных фенотипов. Другими словами, генетическое картирование связь возраста имеет потенциал для определения еще неизвестных генов, которые опосредуют важно, естественные биологические фенотипы. Сила этого подхода состоит в том, что он не требует никаких априорных допущений о базовой биологии признака, так долго, как это отличается от природных изолятов и может быть надежно измерена. Вперед генетика может ответить на важный вопрос: какой ген (ы) опосредует этот фенотип? Реверс генетические подходы, с другой стороны, лучше всего подходят для задавать более определенные вопросы, такие как: это специфический ген опосредует конкретный фенотип? В то время как обратная генетика может теоретически быть применена к любому гену (гены, существенные могут потребовать регулируемую систему для разрушения), она не может расставить приоритеты генов для исследования или систематически идентифицировать неизвестные гены, которые опосредуют фенотип. Эти два альтер нативных стратегий дают доступ к очень разным наборам генов, таким образом, когда они сталкиваются с вопросом: какие гены имеют важное значение для вирулентности? Обратные генетические подходы определили несколько генов в Т. гондий, которые являются важными для инфекции - (. Cérede и др, 2005) (. Хюинь и др, 2003), включая MIC1-MIC3, GRA2 (. Mercier и др, 1998), M2AP, SAG3 (Dzierszinski и др., 2000), MyoA (Мейснера и др., 2001), AMA1 (Mital и др., 2005), и CPSII (Fox и Bzik, 2002). Тем не менее, эти гены не объясняют естественные различия в острой вирулентности между штаммами Т. гондием; не может быть обратной генетики используются эффективно найти такие гены. Эти два альтер нативных стратегий дают доступ к очень разным наборам генов, таким образом, когда они сталкиваются с вопросом: какие гены имеют важное значение для вирулентности? Обратные генетические подходы определили несколько генов в Т. гондий, которые являются важными для инфекции - (. Cérede и др, 2005) (. Хюинь и др, 2003), включая MIC1-MIC3, GRA2 (. Mercier и др, 1998), M2AP, SAG3 (Dzierszinski и др., 2000), MyoA (Мейснера и др., 2001), AMA1 (Mital и др., 2005), и CPSII (Fox и Bzik, 2002). Тем не менее, эти гены не объясняют естественные различия в острой вирулентности между штаммами Т. гондием; не может быть обратной генетики используются эффективно найти такие гены. Эти два альтер нативных стратегий дают доступ к очень разным наборам генов, таким образом, когда они сталкиваются с вопросом: какие гены имеют важное значение для вирулентности? Обратные генетические подходы определили несколько генов в Т. гондий, которые являются важными для инфекции - (. Cérede и др, 2005) (. Хюинь и др, 2003), включая MIC1-MIC3, GRA2 (. Mercier и др, 1998), M2AP, SAG3 (Dzierszinski и др., 2000), MyoA (Мейснера и др., 2001), AMA1 (Mital и др., 2005), и CPSII (Fox и Bzik, 2002). Тем не менее, эти гены не объясняют естественные различия в острой вирулентности между штаммами Т. гондием; не может быть обратной генетики используются эффективно найти такие гены. гондий, которые имеют важное значение для инфекции - (. Cérede и др, 2005) (. Хюинь и др, 2003) (. Dzierszinski и др, 2000), включая MIC1-MIC3, GRA2 (. Mercier и др, 1998), M2AP, SAG3, MyoA (Мейснера и др., 2001), AMA1 (Mital и др., 2005), и CPSII (Fox и Bzik, 2002). Тем не менее, эти гены не объясняют естественные различия в острой вирулентности между штаммами Т. гондием; не может быть обратной генетики используются эффективно найти такие гены. гондий, которые имеют важное значение для инфекции - (. Cérede и др, 2005) (. Хюинь и др, 2003) (. Dzierszinski и др, 2000), включая MIC1-MIC3, GRA2 (. Mercier и др, 1998), M2AP, SAG3, MyoA (Мейснера и др., 2001), AMA1 (Mital и др., 2005), и CPSII (Fox и Bzik, 2002). Тем не менее, эти гены не объясняют естественные различия в острой вирулентности между штаммами Т. гондием; не может быть обратной генетики используются эффективно найти такие гены.

 

Штаммы Т. гондий существенно различаются по их способности вызывать заболевания у животных моделей. Более конкретно, штаммы типа I генотипа остро вирулентные в модели мыши. Тип I штаммы равномерно летальные у мышей и, даже при низком INOC-ул, зараженные животные не выживают вызов с тахизоитами данных по IP инокуляция (транс-покойных в эффективный Л.Д.100из одного организма) (Сибли и Бутройда, 1992a;. Howe и др, 1996). В отличии от этого, типа II, и III, относительно не вирулентные и обычно имеет LD50е годы > 103 (Сибли и


 

 

Boothroyd, 1992а; Хау и др., 1996). Человеческие инфекции чаще всего вызваны штаммами типа II (Howe и Сиб, 1995; Хау и соавт, 1997;.. Айзенберг и др, 2002о, 2002b), однако некоторые исследования показывают, штаммы, типа I, или штаммы, несущие аллели обычно встречается в типа I штаммы, также являются более патогенными в организме человека (Фуэнтес и др., 2001;. Григга и др, 2001b;. Хан и др, 2005b). Модель мыши предлагает наибольший потенциал, чтобы раскрыть биологические различия в острой вирулентности между природными изолятов Т. гондий.

 

Количественное отображение черта было использовано для оценки острой вирулентности T.gondii, в мышиной модели (Су и др., 2002). Для того, чтобы исследовать генетическую основу острого вирулентности, высоко вирулентный штамм типа I. называется GT-1 (Dubey, 1980) скрещивали с не-вирулентного штамма типа III КТГ (Pfefferkorn и др., 1977). GT-1 имеет вирулентный фенотип типичных штаммов типа I, в то время как КТГ имеет LD50 из ~ 103в беспородных мышах (Су и др., 2002). Для идентификации уникальных клонов, потомство было проведено генотипирование с использованием polymor-гомеоморфный ПДРФ маркеров, распределенных по геному. Отдельно, каждый клон был проверен, чтобы установить вирулентности фенотип у мышей после inocu-10 с ушной1, 102 или 103тахизоиты. Вирулентность была определена на основе совокупной смертности: Viru-одолжил клоны не приводят к хронической инфекции (все инфицированные животные поддаются), в то время как клоны с промежуточными уровнями вирулентности были классифицированы как высокие (70-95 процент смертности, но с chroni-ский инфицированными выжившие), промежуточная (30-70 процент смертности) и низкая (< 30 процентов смертности) вирулентность.

 

 

Фенотипический анализ рекомбинантного потомства выявили ряд фенотипов от полностью вирулентных к не-вирулентных, и в том числе промежуточных уровней, не видели в любой родительский штамм (Су и др., 2002). Эти результаты свидетельствуют о том, что вирулентность в значительной степени herita-BLE, а не эпигенетические, и что это, скорее всего, мульти-генный. При острой смертности считается одной модели гена, он отображает на один QTL в центральной области хромосомы VIIa (Су и др., 2002; Хан и др., 2005a). Кроме того, когда кумулятивный смертных итй моделируется на основе предположения, что это может быть связано с несколькими генами, основной вклад еще находится на хромосоме VIIa. ЛКП на CHRO-mosome VIIa примыкают маркер M95-CS10-A6


БУДУЩИЕ ВЫЗОВЫ  

 


 

с небольшими взносами из других областей генома (Су и др., 2002; Khan и др., 2005a). Эта находка предполагает, что один генетический локус в значительной степени отвечает за вирулентность фенотипа Тохо-plasmosis у мышей. Более ранние исследования выдвинули на первый план потенциал для других областей генома также внести свой вклад в этот фенотип, в частности хромосоме IV (Су и др., 2002); Однако, в настоящее время статистическая поддержка этих областей является низким, и они не могут быть подтверждены путем дальнейшего анализа. Тем не менее, вполне логично предположить, что другие гены будут влиять на признак острой вирулентности.

 

Природные различия видели в вирулентности между тремя родословными, вероятно, из-за различный ASSORT-ление аллелей они приобрели, следуя относительно мало генетических кресты, так как их общего происхождение (Григг и Suzuki, 2003; Су и др, 2003о.). Две модели могли бы объяснить гораздо более высокий уровень Виру-Ленчик в тип I рода. Во-первых, эта линия может унаследовали предварительно существующий ген вирулентности от одного из двух родительских штаммов, разделяемых тремя клональных линий. В качестве альтернативы, ни родительский штамм может быть выражено эту черту, и только через реассортации / рекомбинации аллелей сделал вирулентность полностью манифеста в потомстве. Существует преимущество для этой последней модели, поскольку рекомбинация между потомством II×крест III, привел к повышенной вирулентности одного из потомства (хотя и не до крайнего уровня, демонстрируемого штаммы I типа) (Григг и др., 2001a). Дальнейший анализ этой вирулентности QTL должен обеспечивать идентификацию гена, ответственного за повышенную смертность. Обратные генетические подходы могут быть затем использованы для тестирования роли специфических генов путем замены аллелей между родословных, или путем делеции гена Analy-лиза (Руса и др., 1994). Кроме того, более широкое исследование природных изолятов может выявить клоны со Ances-Трал генотипа, которые могли бы помочь решить происхождение крайней вирулентности манифеста типа I рода.

 

 

БУДУЩИЕ ВЫЗОВЫ

 



Поделиться:




Поиск по сайту

©2015-2024 poisk-ru.ru
Все права принадлежать их авторам. Данный сайт не претендует на авторства, а предоставляет бесплатное использование.
Дата создания страницы: 2019-06-03 Нарушение авторских прав и Нарушение персональных данных


Поиск по сайту: