Отображение количественных признаков

Многие фенотипические черты, такие как рост и Вира-Ленчик, не регулируется одного локусом, а комбинация генов в различных локусах. Кроме того, другие области генома могут модулировать черты, которые сильно повлияли на одного локуса. Исследования Lander и Botstein (Lander и др, 1987;. Lander и Botstein, 1989; Lander и Кругляк, 1995) при условии, что founda Тион для генетического анализа сложных признаков. В частности, эти исследования показали, что отображение между валом на основе генетических маркеров можно достоверно сопоставить количественные локусы (QTL,). Силы стратегий картирования QTL для анализа сложных фено-типов привели к большому интересу в применении этой технологии в паразитах (Су и Wootton, 2004). ЛКП анализ не только оценивает вклад

0 50 100 150

ARA

РИСУНОК 14.4 Геномная шириной сканирование для картирования лекарственной устойчивости у Т. гондий. QTL сканирование было выполнено для маркеров устойчивости к лекарственным препаратам ОЯТ, ФУДРО и AraA. Графики показывают логарифмические отношения правдоподобия для ассоциации между генетическими производителями (перечислено последовательно вдоль нижней оси) и фенотипами устойчивости к лекарственным средствам. Общее количество маркеров здесь (175) соответствует тем, которые являются информативными для I×III крест. Границы Хромосомные показаны вертикальными линиями. Сопротивление SNF отображается на хромосому IX, ФУДР сопоставляются хромосома XI и AraA сопоставляются хромосома XII. Нижняя горизонтальная пунктирная линия соответствует вероятности 1,7, в то время как верхняя линия соответствует вероятности 3. воспроизведено из Хан и др. (2005а), с разрешения.

различных локусы; он также предоставляет статистические методы Данное объединение является реальным по сравнению с вероятностью того, что

учитывать потенциал для ложноположительных ассоциативного это может произойти случайно. Результаты этих

ciations, что происходит с большими наборами данных (Lynch и расчеты называются отношения правдоподобия

Walsh, 1998). В большинстве биологических экспериментов, статистики или логарифмическое отношение шансов (т.е. оценка LOD) (Lynch

статистические тесты, основанные на пару-поумнело сравнения и Уолш, 1998). Как правило, LOD баллы> 3 являются

как правило, имеют отсечку р <0,05. Тем не менее, когда считается значительным, но очень сильная поддержка

большое количество парных сравнений требует LOD десятки >5-6. Тем не менее, даже с низким

проводится в одном анализе, как и в случае с LOD баллы могут обеспечить значимые подсказки о том,

связь исследования, этот ложноположительный является неприемом локусов, которые могут внести свой вклад в черта, и это может

ceptably высоко. Обычно это объясняется более оправдать анализ дальнейшего потомства с целью

Соотношение вероятности того, что относится к вероятности того, что подтвердить или опровергнуть предварительную ассоциацию.

384 РАЗРАБОТКА И ПРИМЕНЕНИЕ В классической генетике токсоплазма