Когда была проведена вся последовательность генома T. гондий, это было сделано в качестве дробовика подхода без пользы физической карты. Позиции генетических маркеров были затем использованы для сборки больших строительных лесов из генома в целом-хромосомы супер-сборок (Хан и др., 2005а). Каркасы являются узлами, которые состоят из контигов (перекрывающиеся последовательности считывают) соединенные в некоторых случаях коротких промежутков, которые мостиковые конечные последовательностями из специфических клонов. На картах хромосом для T. гондия состоит из всех больших строительных лесов (более 100 кб), которые в совокупности составляют>95 процентов от оценки 65-Мб генома (рис 14.3). Остальные каркасы в основном небольшие контиги из> 10 кб, которые не могут быть
| Айова | III | IV | VI | ||||||||||||||||||
| AK3 | AK17 | cB8-9 | AK70 | ||||||||||||||||||
| AK95 | c18-ТА8 | ||||||||||||||||||||
| 6,5 | 3,8 | cA5-22 | |||||||||||||||||||
| AK150 | 3,4 | AK119 | 2,9 | AK98 | 9,8 | ||||||||||||||||
| c29-2 | 2,8 | BSR4 | |||||||||||||||||||
| 9,8 | 4,3 | AK96 | M33 | XM195 | |||||||||||||||||
| cB21-4 | 4,2 | Bc18U | 3,2 | AK72 | |||||||||||||||||
| AK151 | Bs226 | KT-950 | |||||||||||||||||||
| M48 | AK97 | 6,6 | AK73 | ||||||||||||||||||
| AK158 | 7,1 | AK36 | |||||||||||||||||||
| 9,7 | AK4 | AK18 | ПК1 | ||||||||||||||||||
| 1.4 | |||||||||||||||||||||
| 20,2 | KT -c20R AK88 | ||||||||||||||||||||
| 2,9 | AK89 AK99 | 6,5 | |||||||||||||||||||
| AK1 | 7,1 | AK120 | 3,2 | L53 | |||||||||||||||||
| AK117 | |||||||||||||||||||||
| 7,2 | AK19 | ||||||||||||||||||||
| 29,3 сМ | |||||||||||||||||||||
| АК6 | 3,2 | AK39 | |||||||||||||||||||
| AK118 | |||||||||||||||||||||
| 6,3 | ST7a | 10,1 | |||||||||||||||||||
| AK7 | 34,9 сМ | ST12a | |||||||||||||||||||
| 4,4 | 38,5 сМ | ||||||||||||||||||||
| AK2 | |||||||||||||||||||||
| 43,9 сМ | |||||||||||||||||||||
| Ib | II | В | ST4b ST3b | ||||||||||||||||||
| AK15 | ST2a | ||||||||||||||||||||
| 3,2 | MIC 4 | AK57 | ST2b | ||||||||||||||||||
| 6,5 | 7,3 | AK56 RC3 | KT-850 | ||||||||||||||||||
| AK22 | |||||||||||||||||||||
| ACT1 | L351 | ||||||||||||||||||||
| KT -L379A | |||||||||||||||||||||
| C4-5 | 1,5 | AK121 AK100 AK24 | |||||||||||||||||||
| 6,5 | AK16 AK94 | W35487 L31-T3 | AK101 KT-L354 AK14 | ||||||||||||||||||
| 14.4 сМ | |||||||||||||||||||||
| c22-8 | |||||||||||||||||||||
| 16,2 сМ | |||||||||||||||||||||
| L358 | |||||||||||||||||||||
| KT-Са5 | |||||||||||||||||||||
| cS1-13 | |||||||||||||||||||||
| AK25 AK102 | |||||||||||||||||||||
28,4 сМ
| VIIa | VIII | ||||||||
| SAG4 | AK46 | ||||||||
| 2,9 | Bs328 | 6,5 | |||||||
| M95 CS1 | |||||||||
| 1.4 | CS4 AK28 CS12 | АК 47 | |||||||
| 1,5 | |||||||||
| CS2 CS11 CS10 CS5 6,5 | |||||||||
| 1,5 | |||||||||
| 4,2 | CS3 CS6 | AK111 | |||||||
| MIC11 CS7 | 3,2 | ||||||||
| AK43 CS8 | AK112 | ||||||||
| 7,2 | CS9 | 3,2 | |||||||
| AK162 | |||||||||
| TgSUB1 | 3,3 | ||||||||
| CS10-A6 | AK152 | ||||||||
| 5,7 | AK109 | 3,3 | |||||||
| M102 | AK49 | ||||||||
| 1.4 | |||||||||
| AK44 | |||||||||
| 1.4 | 6,7 | ||||||||
| AK29 | SRS1 | ||||||||
| 1.4 | MIC2 | ||||||||
| 1,5 | SAG1.c | ||||||||
| AK110 | |||||||||
| AK82 | SRS2 | ||||||||
| KT - c16AR | 9,7 | ||||||||
| KT - c20B | |||||||||
| AK113 | |||||||||
| 30,1 сМ | |||||||||
| AK50 | |||||||||
| 9,7 | AK51 | ||||||||
| AK52 | |||||||||
| AK30 | |||||||||
| SAG2 | |||||||||
| 5,8 | GRA1 | ||||||||
| MAG1 | |||||||||
| 4,2 | KT-C13r | ||||||||
| KT-c24A | |||||||||
| 2,6 | AK53 | ||||||||
| AK114 | |||||||||
| VIIb | RC2 | ||||||||
| 64,7 сМ | |||||||||
| AK103 | |||||||||
| L339 | |||||||||
| L363 | |||||||||
| AK104 | |||||||||
| AK105 | |||||||||
| cA5-2 | |||||||||
| AK106 | |||||||||
| АК-107 | |||||||||
| AK108 | |||||||||
| AK26 | |||||||||
| AK27 | |||||||||
| 32,4 сМ |
IX
| ST5A | |||||
| ST5B | |||||
| 9,9 | ST6A | ||||
| AK85 | |||||
| 6,5 | AK86 | ||||
| AK87 AK54 | |||||
| 1,1 | BTUB AK31 | ||||
| AK55 RC1 | |||||
| 1,7 | |||||
| L375 AK58 | |||||
| 1,7 | KT-L376 | ||||
| 7,3 | |||||
| AK59 | |||||
| KT -L62A | |||||
| 7,3 | |||||
| AK123 AK60 | |||||
| AK124 MIC1 | |||||
| 8,6 | SNF | ||||
| SAG5C | |||||
| 2,1 | AK92 AK93 | ||||
| B1.c | |||||
| 3,2 | |||||
| AK125 | |||||
| 9,8 | AK126 | ||||
| AK127 | |||||
59,2 сМ
| Икс | XI | XII | |||||||||||
| 2.5 | ST10A AK62 | AK142 | AK37 | ||||||||||
| AK128 IMC 2 | 3,2 | AK83 AK134 AK143 | |||||||||||
| 4,3 | AK129 | 7,1 | |||||||||||
| 3,4 | AK133 AK135 ROP1 | ||||||||||||
| GRA2 | AK10 | 2,8 | AK145 | ||||||||||
| 4,2 | 3,2 | ||||||||||||
| GRA3 | GRA4 | SAG3 AK78 | |||||||||||
| 2,7 | AK63 | 7,1 | AK156 M6 | ||||||||||
| AK64 | |||||||||||||
| 1.4 | |||||||||||||
| ak65 | 9,8 | 3,7 | M144 MIC6 | ||||||||||
| 7,7 | |||||||||||||
| CRK2 | |||||||||||||
| AK141 | |||||||||||||
| SRS4 | 3,2 | 3,7 | |||||||||||
| AK155B AK1554A | AK91 AK90 | ||||||||||||
| 4,3 | AK33 | 2,0 | PKGc1-24 | 3,8 | |||||||||
| AK66 | УПРТ ФУДР | AK115 АК74 | |||||||||||
| 4.5 | AK130 | 3,3 | AK137 | 7,6 | |||||||||
| 2,1 | |||||||||||||
| AK131 | |||||||||||||
| 2,1 | 9,8 | L31-T7 | |||||||||||
| c19-TA3 | |||||||||||||
| 8,5 | AK34 | 3,2 | AK11 | 7,6 | AK75 | ||||||||
| AK153 | |||||||||||||
| AK138 | |||||||||||||
| AK32 | 3,3 | L344 | 3,7 | AK116 | |||||||||
| KT-c18B | |||||||||||||
| 2,9 | AK132 | AK20 | |||||||||||
| AK67 | 3,3 | AK12 | 2,8 | L353.c | |||||||||
| 2,9 | AK139 | 2,7 | DHRTS | ||||||||||
| L366 | 3,2 | AK165 | |||||||||||
| 1,9 | AK140 AK149 | TgCP1 | |||||||||||
| 1,9 | M2AP | AK80 AK81 | 7,1 | ||||||||||
| 1,9 | AK154 | ||||||||||||
| AK157 | 50,9 сМ | AK ARA | |||||||||||
| 7,1 | 3,8 | ||||||||||||
| B10 | |||||||||||||
| AK69 | 3,7 | ||||||||||||
| 2,9 | AK148 | 3,7 | KT -c20F | ||||||||||
| 2.5 | GRA6 | AK77 | |||||||||||
| RC4 | 3,7 | ||||||||||||
| M163 | |||||||||||||
| 68,3 сМ | |||||||||||||
| 3,2 | BM17053 | ||||||||||||
| MIC5 | |||||||||||||
77,8 сМ
| РАЗРАБОТКА И ПРИМЕНЕНИЕ В классической генетике токсоплазма |
РИСУНОК 14.2 Генетическая связь карты для Т. гондий. Есть 14 признанных группы сцепления для Т. гондий. Вертикальные карты предоставляются для каждой хромосомы, откалиброваны в сантиморганах (перечислено в левом и составил в нижней части каждой хромосомы). Индивидуальные маркеры перечислены в правой части каждой хромосомы. Более подробную информацию можно найти на сайте https://ToxoMap.wustl.edu. Воспроизведено из Хан и др. (2005а), с разрешения.
| ПРИМЕНЕНИЕ Генетическое картирование |
| XII | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| XI | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Поиск по сайту©2015-2024 poisk-ru.ru
Все права принадлежать их авторам. Данный сайт не претендует на авторства, а предоставляет бесплатное использование. Дата создания страницы: 2019-06-03 Нарушение авторских прав и Нарушение персональных данных |
Поиск по сайту: Читайте также: Деталирование сборочного чертежа Когда производственнику особенно важно наличие гибких производственных мощностей? Собственные движения и пространственные скорости звезд |